Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ZBTB7B
Ідентифікатори
Символи
ZBTB7B , THPOK, ZBTB15, ZFP-67, ZFP67, ZNF857B, c-KROX, hcKROX, CKROX, zinc finger and BTB domain containing 7B
Зовнішні ІД
OMIM : 607646 MGI: 102755 HomoloGene: 7605 GeneCards: ZBTB7B
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • histone deacetylase binding
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес
• multicellular organism development • ectoderm development • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation • regulation of CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • регуляція експресії генів • negative regulation of T-helper 17 cell differentiation • лактація • GO:1901313 positive regulation of gene expression • response to insulin • positive regulation of CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation • negative regulation of CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation • GO:1903106 positive regulation of insulin receptor signaling pathway • positive regulation of brown fat cell differentiation • adaptive thermogenesis • positive regulation of SREBP signaling pathway • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • NK T cell differentiation • negative regulation of gene expression • positive regulation of histone deacetylation • negative regulation of NK T cell proliferation • positive regulation of cold-induced thermogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 155 – 155.02 Mb
Хр. 3: 89.28 – 89.3 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ZBTB7B (англ. Zinc finger and BTB domain containing 7B ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 539 амінокислот , а молекулярна маса — 58 027[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MGSPEDDLIG IPFPDHSSEL LSCLNEQRQL GHLCDLTIRT QGLEYRTHRA
VLAACSHYFK KLFTEGGGGA VMGAGGSGTA TGGAGAGVCE LDFVGPEALG
ALLEFAYTAT LTTSSANMPA VLQAARLLEI PCVIAACMEI LQGSGLEAPS
PDEDDCERAR QYLEAFATAT ASGVPNGEDS PPQVPLPPPP PPPPRPVARR
SRKPRKAFLQ TKGARANHLV PEVPTVPAHP LTYEEEEVAG RVGSSGGSGP
GDSYSPPTGT ASPPEGPQSY EPYEGEEEEE ELVYPPAYGL AQGGGPPLSP
EELGSDEDAI DPDLMAYLSS LHQDNLAPGL DSQDKLVRKR RSQMPQECPV
CHKIIHGAGK LPRHMRTHTG EKPFACEVCG VRFTRNDKLK IHMRKHTGER
PYSCPHCPAR FLHSYDLKNH MHLHTGDRPY ECHLCHKAFA KEDHLQRHLK
GQNCLEVRTR RRRKDDAPPH YPPPSTAAAS PAGLDLSNGH LDTFRLSLAR
FWEQSAPTGP PVSTPGPPDD DEEEGAPTTP QAEGAMESS
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , білків розвитку , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Widom R.L., Culic I., Lee J.Y., Korn J.H. (1997). Cloning and characterization of hcKrox, a transcriptional regulator of extracellular matrix gene expression. Gene . 198 : 407—420. PMID 9370309 DOI :10.1016/S0378-1119(97)00360-0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші