IRF5

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
IRF5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи IRF5, SLEB10, interferon regulatory factor 5
Зовнішні ІД OMIM: 607218 MGI: 1350924 HomoloGene: 8088 GeneCards: IRF5
Пов'язані генетичні захворювання
ревматоїдний артрит, inflammatory bowel disease 14[1]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001252382
NM_012057
NM_001311083
RefSeq (білок)
NP_001239311
NP_001298012
NP_036187
Локус (UCSC) Хр. 7: 128.94 – 128.95 Mb Хр. 6: 29.53 – 29.54 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

IRF5 (англ. Interferon regulatory factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 498 амінокислот, а молекулярна маса — 56 044[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNQSIPVAPTPPRRVRLKPWLVAQVNSCQYPGLQWVNGEKKLFCIPWRHA
TRHGPSQDGDNTIFKAWAKETGKYTEGVDEADPAKWKANLRCALNKSRDF
RLIYDGPRDMPPQPYKIYEVCSNGPAPTDSQPPEDYSFGAGEEEEEEEEL
QRMLPSLSLTEDVKWPPTLQPPTLRPPTLQPPTLQPPVVLGPPAPDPSPL
APPPGNPAGFRELLSEVLEPGPLPASLPPAGEQLLPDLLISPHMLPLTDL
EIKFQYRGRPPRALTISNPHGCRLFYSQLEATQEQVELFGPISLEQVRFP
SPEDIPSDKQRFYTNQLLDVLDRGLILQLQGQDLYAIRLCQCKVFWSGPC
ASAHDSCPNPIQREVKTKLFSLEHFLNELILFQKGQTNTPPPFEIFFCFG
EEWPDRKPREKKLITVQVVPVAARLLLEMFSGELSWSADSIRLQISNPDL
KDRMVEQFKELHHIWQSQQRLQPVAQAPPGAGLGVGQGPWPMHPAGMQ

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Barnes B.J., Moore P.A., Pitha P.M. (2001). Virus-specific activation of a novel interferon regulatory factor, IRF-5, results in the induction of distinct interferon alpha genes. J. Biol. Chem. 276: 23382—23390. PMID 11303025 DOI:10.1074/jbc.M101216200
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Barnes B.J., Kellum M.J., Field A.E., Pitha P.M. (2002). Multiple regulatory domains of IRF-5 control activation, cellular localization, and induction of chemokines that mediate recruitment of T lymphocytes. Mol. Cell. Biol. 22: 5721—5740. PMID 12138184 DOI:10.1128/MCB.22.16.5721-5740.2002
  • Lin R., Yang L., Arguello M., Penafuerte C., Hiscott J. (2005). A CRM1-dependent nuclear export pathway is involved in the regulation of IRF-5 subcellular localization. J. Biol. Chem. 280: 3088—3095. PMID 15556946 DOI:10.1074/jbc.M408452200
  • Balkhi M.Y., Fitzgerald K.A., Pitha P.M. (2008). Functional regulation of MyD88-activated interferon regulatory factor 5 by K63-linked polyubiquitination. Mol. Cell. Biol. 28: 7296—7308. PMID 18824541 DOI:10.1128/MCB.00662-08
  • Chang Foreman H.C., Van Scoy S., Cheng T.F., Reich N.C. (2012). Activation of interferon regulatory factor 5 by site specific phosphorylation. PLoS ONE. 7: E33098—E33098. PMID 22412986 DOI:10.1371/journal.pone.0033098

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з IRF5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6120 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. UniProt, Q13568 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]