Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
RAX
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| RAX, MCOP3, RX, retina and anterior neural fold homeobox |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 601881 MGI: 109632 HomoloGene: 8383 GeneCards: RAX
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
isolated microphthalmia 3[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• pattern specification process • multicellular organism development • camera-type eye development • brain development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • hypothalamus development • limb development • зір
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 18: 59.27 – 59.27 Mb
| Хр. 18: 66.06 – 66.07 Mb
|
---|
PubMed search |
[2]
| [3] |
---|
Вікідані |
|
RAX (англ. Retina and anterior neural fold homeobox) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот, а молекулярна маса — 36 676[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MHLPGCAPAM | | ADGSFSLAGH | | LLRSPGGSTS | | RLHSIEAILG | | FTKDDGILGT |
FPAERGARGA | | KERDRRLGAR | | PACPKAPEEG | | SEPSPPPAPA | | PAPEYEAPRP |
YCPKEPGEAR | | PSPGLPVGPA | | TGEAKLSEEE | | QPKKKHRRNR | | TTFTTYQLHE |
LERAFEKSHY | | PDVYSREELA | | GKVNLPEVRV | | QVWFQNRRAK | | WRRQEKLEVS |
SMKLQDSPLL | | SFSRSPPSAT | | LSPLGAGPGS | | GGGPAGGALP | | LESWLGPPLP |
GGGATALQSL | | PGFGPPAQSL | | PASYTPPPPP | | PPFLNSPPLG | | PGLQPLAPPP |
PSYPCGPGFG | | DKFPLDEADP | | RNSSIAALRL | | KAKEHIQAIG | | KPWQAL |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|