PAX8

PAX8
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2K27
Ідентифікатори
Символи	PAX8, paired box 8, PAX-8
Зовнішні ІД	OMIM: 167415 MGI: 97492 HomoloGene: 2589 GeneCards: PAX8
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • thyroid-stimulating hormone receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process; • pronephros development; • regulation of metanephric nephron tubule epithelial cell differentiation; • диференціація клітин; • mesonephric tubule development; • positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis; • kidney epithelium development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of metanephric DCT cell differentiation; • negative regulation of mesenchymal cell apoptotic process involved in metanephric nephron morphogenesis; • negative regulation of apoptotic process involved in metanephric collecting duct development; • розвиток нирки; • pronephric field specification; • positive regulation of mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis; • anatomical structure morphogenesis; • metanephric epithelium development; • mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis; • transcription by RNA polymerase II; • regulation of thyroid-stimulating hormone secretion; • transcription, DNA-templated; • otic vesicle development; • metanephric distal convoluted tubule development; • negative regulation of mesenchymal cell apoptotic process involved in metanephros development; • mesonephros development; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • metanephric nephron tubule formation; • multicellular organism development; • central nervous system development; • metanephric comma-shaped body morphogenesis; • branching involved in ureteric bud morphogenesis; • thyroid gland development; • positive regulation of thyroid hormone generation; • negative regulation of apoptotic process involved in metanephric nephron tubule development; • S-shaped body morphogenesis; • inner ear morphogenesis; • urogenital system development; • sulfur compound metabolic process; • metanephric S-shaped body morphogenesis; • metanephros development; • cellular response to gonadotropin stimulus; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • thyroid-stimulating hormone signaling pathway; • negative regulation of cardiac muscle cell apoptotic process; • ventricular septum development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	7849
	18510
	ENSG00000125618
	ENSMUSG00000026976
	Q06710
	Q00288
	NM_003466; NM_013951; NM_013952; NM_013953; NM_013992
	NM_011040
	NP_003457; NP_039246; NP_039247; NP_054698
	NP_035170
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PAX8 (англ. Paired box 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 450 амінокислот, а молекулярна маса — 48 218^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPHNSIRSGH	GGLNQLGGAF	VNGRPLPEVV	RQRIVDLAHQ	GVRPCDISRQ
LRVSHGCVSK	ILGRYYETGS	IRPGVIGGSK	PKVATPKVVE	KIGDYKRQNP
TMFAWEIRDR	LLAEGVCDND	TVPSVSSINR	IIRTKVQQPF	NLPMDSCVAT
KSLSPGHTLI	PSSAVTPPES	PQSDSLGSTY	SINGLLGIAQ	PGSDKRKMDD
SDQDSCRLSI	DSQSSSSGPR	KHLRTDAFSQ	HHLEPLECPF	ERQHYPEAYA
SPSHTKGEQG	LYPLPLLNST	LDDGKATLTP	SNTPLGRNLS	THQTYPVVAD
PHSPFAIKQE	TPEVSSSSST	PSSLSSSAFL	DLQQVGSGVP	PFNAFPHAAS
VYGQFTGQAL	LSGREMVGPT	LPGYPPHIPT	SGQGSYASSA	IAGMVAGSEY
SGNAYGHTPY	SSYSEAWRFP	NSSLLSSPYY	YSSTSRPSAP	PTTATAFDHL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Kozmik Z., Kurzbauer R., Doerfler P., Busslinger M. (1993). Alternative splicing of Pax-8 gene transcripts is developmentally regulated and generates isoforms with different transactivation properties. Mol. Cell. Biol. 13: 6024—6035. PMID 8413205 doi:10.1128/MCB.13.10.6024
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8622 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q06710 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8622 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q06710 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]