Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
SOX10
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| SOX10, DOM, PCWH, WS2E, WS4, WS4C, SRY-box 10, SRY-box transcription factor 10, SOX-10 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 602229 MGI: 98358 HomoloGene: 5055 GeneCards: SOX10
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Waardenburg syndrome type 2E, Waardenburg syndrome type 4C, PCWH syndrome, Waardenburg-Shah syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • promoter-specific chromatin binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
|
---|
Клітинна компонента |
• цитоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро • Хроматин • мітохондрія • мітохондріальна зовнішня мембрана • мембрана • extrinsic component of mitochondrial outer membrane
|
---|
Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • transcription, DNA-templated • stem cell differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • negative regulation of Schwann cell proliferation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of myelination • cellular response to progesterone stimulus • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • oligodendrocyte development • central nervous system myelination • oligodendrocyte differentiation • in utero embryonic development • neural crest cell migration • morphogenesis of an epithelium • positive regulation of neuroblast proliferation • central nervous system development • peripheral nervous system development • positive regulation of gliogenesis • диференціація клітин • melanocyte differentiation • lacrimal gland development • negative regulation of apoptotic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cell maturation • enteric nervous system development • digestive tract morphogenesis • developmental growth • morphogenesis of a branching epithelium • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 22: 37.97 – 37.99 Mb
| Хр. 15: 79.04 – 79.05 Mb
|
---|
PubMed search |
[2]
| [3] |
---|
Вікідані |
|
SOX10 (англ. SRY-box 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 466 амінокислот, а молекулярна маса — 49 911[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAEEQDLSEV | | ELSPVGSEEP | | RCLSPGSAPS | | LGPDGGGGGS | | GLRASPGPGE |
LGKVKKEQQD | | GEADDDKFPV | | CIREAVSQVL | | SGYDWTLVPM | | PVRVNGASKS |
KPHVKRPMNA | | FMVWAQAARR | | KLADQYPHLH | | NAELSKTLGK | | LWRLLNESDK |
RPFIEEAERL | | RMQHKKDHPD | | YKYQPRRRKN | | GKAAQGEAEC | | PGGEAEQGGT |
AAIQAHYKSA | | HLDHRHPGEG | | SPMSDGNPEH | | PSGQSHGPPT | | PPTTPKTELQ |
SGKADPKRDG | | RSMGEGGKPH | | IDFGNVDIGE | | ISHEVMSNME | | TFDVAELDQY |
LPPNGHPGHV | | SSYSAAGYGL | | GSALAVASGH | | SAWISKPPGV | | ALPTVSPPGV |
DAKAQVKTET | | AGPQGPPHYT | | DQPSTSQIAY | | TSLSLPHYGS | | AFPSISRPQF |
DYSDHQPSGP | | YYGHSGQASG | | LYSAFSYMGP | | SQRPLYTAIS | | DPSPSGPQSH |
SPTHWEQPVY | | TTLSRP |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|