Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
RORB
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| RORB, NR1F2, ROR-BETA, RZR-BETA, RZRB, bA133M9.1, RAR-related orphan receptor beta, RAR related orphan receptor B, EIG15 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 601972 MGI: 1343464 HomoloGene: 38250 GeneCards: RORB
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
аметропія, generalized epilepsy[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
третиноїн[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • transcription factor binding • зв'язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • melatonin receptor activity
|
---|
Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• cellular response to retinoic acid • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • відповідь на стимул • ритмічний процес • retinal cone cell development • negative regulation of osteoblast differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • regulation of circadian rhythm • retinal rod cell development • eye photoreceptor cell development • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • зір • steroid hormone mediated signaling pathway • intracellular receptor signaling pathway • amacrine cell differentiation • retina development in camera-type eye • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • G protein-coupled receptor signaling pathway • transcription by RNA polymerase II
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 9: 74.5 – 74.69 Mb
| Хр. 19: 18.91 – 19.09 Mb
|
---|
PubMed search |
[3]
| [4] |
---|
Вікідані |
|
RORB (англ. Nuclear receptor ROR-beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 470 амінокислот, а молекулярна маса — 53 220[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MCENQLKTKA | | DATAQIEVIP | | CKICGDKSSG | | IHYGVITCEG | | CKGFFRRSQQ |
NNASYSCPRQ | | RNCLIDRTNR | | NRCQHCRLQK | | CLALGMSRDA | | VKFGRMSKKQ |
RDSLYAEVQK | | HQQRLQEQRQ | | QQSGEAEALA | | RVYSSSISNG | | LSNLNNETSG |
TYANGHVIDL | | PKSEGYYNVD | | SGQPSPDQSG | | LDMTGIKQIK | | QEPIYDLTSV |
PNLFTYSSFN | | NGQLAPGITM | | TEIDRIAQNI | | IKSHLETCQY | | TMEELHQLAW |
QTHTYEEIKA | | YQSKSREALW | | QQCAIQITHA | | IQYVVEFAKR | | ITGFMELCQN |
DQILLLKSGC | | LEVVLVRMCR | | AFNPLNNTVL | | FEGKYGGMQM | | FKALGSDDLV |
NEAFDFAKNL | | CSLQLTEEEI | | ALFSSAVLIS | | PDRAWLIEPR | | KVQKLQEKIY |
FALQHVIQKN | | HLDDETLAKL | | IAKIPTITAV | | CNLHGEKLQV | | FKQSHPEIVN |
TLFPPLYKEL | | FNPDCATGCK |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|