Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NR2F1
Ідентифікатори
Символи
NR2F1 , BBOAS, BBSOAS, COUP-TFI, EAR-3, EAR3, ERBAL3, NR2F2, SVP44, TCFCOUP1, TFCOUP1, nuclear receptor subfamily 2 group F member 1, COUPTF1
Зовнішні ІД
OMIM : 132890 MGI: 1352451 HomoloGene: 21158 GeneCards: NR2F1
Пов'язані генетичні захворювання
optic atrophy-intellectual disability syndrome [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • steroid hormone receptor activity • sequence-specific DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • DNA binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • retinoic acid-responsive element binding
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес
• transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція • steroid hormone mediated signaling pathway • intracellular receptor signaling pathway • positive regulation of nucleic acid-templated transcription • нейробіологія розвитку • negative regulation of neuron projection development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 5: 93.58 – 93.59 Mb
Хр. 13: 78.34 – 78.35 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
NR2F1 (англ. Nuclear receptor subfamily 2 group F member 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 423 амінокислот , а молекулярна маса — 46 156[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAMVVSSWRD PQDDVAGGNP GGPNPAAQAA RGGGGGAGEQ QQQAGSGAPH
TPQTPGQPGA PATPGTAGDK GQGPPGSGQS QQHIECVVCG DKSSGKHYGQ
FTCEGCKSFF KRSVRRNLTY TCRANRNCPI DQHHRNQCQY CRLKKCLKVG
MRREAVQRGR MPPTQPNPGQ YALTNGDPLN GHCYLSGYIS LLLRAEPYPT
SRYGSQCMQP NNIMGIENIC ELAARLLFSA VEWARNIPFF PDLQITDQVS
LLRLTWSELF VLNAAQCSMP LHVAPLLAAA GLHASPMSAD RVVAFMDHIR
IFQEQVEKLK ALHVDSAEYS CLKAIVLFTS DACGLSDAAH IESLQEKSQC
ALEEYVRSQY PNQPSRFGKL LLRLPSLRTV SSSVIEQLFF VRLVGKTPIE
TLIRDMLLSG SSFNWPYMSI QCS
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , рецепторів , активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Zhang Y., Dufau M.L. (2000). Nuclear orphan receptors regulate transcription of the gene for the human luteinizing hormone receptor. J. Biol. Chem . 275 : 2763—2770. PMID 10644740 DOI :10.1074/jbc.275.4.2763
Zhang Y., Dufau M.L. (2001). EAR2 and EAR3/COUP-TFI regulate transcription of the rat LH receptor. Mol. Endocrinol . 15 : 1891—1905. PMID 11682620 DOI :10.1210/mend.15.11.0720
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші