Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
JADE3 (англ. Jade family PHD finger 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 823 амінокислот , а молекулярна маса — 93 808[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MKRHRPVSSS DSSDESPSTS FTSGSMYRIK SKIPNEHKKP AEVFRKDLIS
AMKLPDSHHI NPDSYYLFAD TWKEEWEKGV QVPASPDTVP QPSLRIIAEK
VKDVLFIRPR KYIHCSSPDT TEPGYINIME LAASVCRYDL DDMDIFWLQE
LNEDLAEMGC GPVDENLMEK TVEVLERHCH ENMNHAIETE EGLGIEYDED
VICDVCRSPD SEEGNDMVFC DKCNVCVHQA CYGILKVPEG SWLCRSCVLG
IYPQCVLCPK KGGALKTTKT GTKWAHVSCA LWIPEVSIAC PERMEPITKI
SHIPPSRWAL VCNLCKLKTG ACIQCSIKSC ITAFHVTCAF EHGLEMKTIL
DEGDEVKFKS YCLKHSQNRQ KLGEAEYPHH RAKEQSQAKS EKTSLRAQKL
RELEEEFYSL VRVEDVAAEL GMPTLAVDFI YNYWKLKRKS NFNKPLFPPK
EDEENGLVQP KEESIHTRMR MFMHLRQDLE RVRNLCYMIS RREKLKLSHN
KIQEQIFGLQ VQLLNQEIDA GLPLTNALEN SLFYPPPRIT LKLKMPKSTP
EDHRNSSTET DQQPHSPDSS SSVHSIRNMQ VPQESLEMRT KSYPRYPLES
KNNRLLASLS HSRSEAKESS PAWRTPSSEC YHGQSLGKPL VLQAALHGQS
SIGNGKSQPN SKFAKSNGLE GSWSGNVTQK DSSSEMFCDQ EPVFSPHLVS
QGSFRKSTVE HFSRSFKETT NRWVKNTEDL QCYVKPTKNM SPKEQFWGRQ
VLRRSAGRAP YQENDGYCPD LELSDSEAES DGNKEKVRVR KDSSDRENPP
HDSRRDCHGK SKTHPLSHSS MQR
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Tzouanacou E., Tweedie S., Wilson V. (2003). Identification of Jade1, a gene encoding a PHD zinc finger protein, in a gene trap mutagenesis screen for genes involved in anteroposterior axis development . Mol. Cell. Biol . 23 : 8553—8562. PMID 14612400 DOI :10.1128/MCB.23.23.8553-8562.2003
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization . Nat. Biotechnol . 24 : 1285—1292. PMID 16964243 DOI :10.1038/nbt1240
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші