PDGFRB

PDGFRB
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 1GQ5, 1H9O, 1SHA, 2L6W, 2PLD, 2PLE, 3MJG
Идентификаторы
Псевдонимы	PDGFRB, CD140B, IBGC4, IMF1, JTK12, PDGFR, PDGFR-1, PDGFR1, KOGS, PENTT, platelet derived growth factor receptor beta
Внешние ID	OMIM: 173410 MGI: 97531 HomoloGene: 1960 GeneCards: PDGFRB
Расположение гена (человек) Хр. 5-я хромосома человека[1] Локус 5q32 Начало 150,113,839 bp[1] Конец 150,155,872 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 18-я хромосома мыши[2] Локус 18 E1|18 34.41 cM Начало 61,178,222 bp[2] Конец 61,218,133 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в stromal cell of endometrium tibial arteries Descending thoracic aorta Наибольшая экспрессия в tunica media of zone of aorta epithelium of lens left lung lobe body of femur Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция vascular endothelial growth factor binding kinase activity platelet-derived growth factor-activated receptor activity transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity signaling receptor binding АТФ-связанные protein kinase activity platelet-derived growth factor binding platelet activating factor receptor activity трансферазная активность platelet-derived growth factor receptor binding связывание с белками плазмы protein tyrosine kinase activity protein kinase binding platelet-derived growth factor beta-receptor activity нуклеотид-связывающий phosphatidylinositol 3-kinase binding phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity enzyme binding Компонент клетки цитоплазма мембрана фокальные контакты клеточное ядро apical plasma membrane лизосома экзосома часть мембраны клеточная мембрана lysosomal lumen intrinsic component of plasma membrane цитоплазматическая везикула поверхность клетки аппарат Гольджи часть клеточной мембраны intracellular membrane-bounded organelle receptor complex Биологический процесс positive regulation of MAP kinase activity positive regulation of phospholipase C activity cell migration involved in vasculogenesis cardiac myofibril assembly positive regulation of smooth muscle cell migration фосфорилация белка response to lipid positive regulation of phosphoprotein phosphatase activity positive regulation of reactive oxygen species metabolic process metanephric glomerular mesangial cell proliferation involved in metanephros development positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade cell chemotaxis inner ear development metanephric S-shaped body morphogenesis positive regulation of mitotic nuclear division platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway positive regulation of collagen biosynthetic process phosphatidylinositol metabolic process transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway cell migration involved in coronary angiogenesis metanephric comma-shaped body morphogenesis positive regulation of chemotaxis positive regulation of DNA biosynthetic process protein autophosphorylation platelet-derived growth factor receptor signaling pathway response to toxic substance positive regulation of metanephric mesenchymal cell migration by platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway regulation of actin cytoskeleton organization response to retinoic acid фосфорилирование response to hyperoxia retina vasculature development in camera-type eye metanephric glomerulus morphogenesis metanephric mesenchymal cell migration Заживление ран cellular response to platelet-derived growth factor stimulus негативная регуляция апоптоза response to fluid shear stress response to estrogen хемотаксис metanephric mesenchyme development response to hydrogen peroxide positive regulation of smooth muscle cell proliferation response to estradiol intracellular signal transduction response to organic cyclic compound smooth muscle cell chemotaxis positive regulation of cell migration aorta morphogenesis MAPK cascade positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity metanephric glomerular capillary formation развитие многоклеточного организма positive regulation of calcium ion import glycosaminoglycan biosynthetic process позитивная регуляция пролиферации клеток positive regulation of cell proliferation by VEGF-activated platelet derived growth factor receptor signaling pathway positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling peptidyl-tyrosine phosphorylation миграция клеток передача сигнала positive regulation of Rho protein signal transduction G protein-coupled receptor signaling pathway phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process positive regulation of hepatic stellate cell activation positive regulation of fibroblast proliferation positive regulation of apoptotic process старение человека развитие яичек lung growth negative regulation of platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway phosphatidylinositol-mediated signaling позитивная регуляция сигналов от протеинкиназы В hematopoietic progenitor cell differentiation positive regulation of MAPK cascade Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 5159 18596 Ensembl ENSG00000113721 ENSMUSG00000024620 UniProt P09619 P05622 RefSeq (мРНК) NM_002609 NM_001355016 NM_001355017 NM_001146268 NM_008809 RefSeq (белок) NP_002600 NP_001341945 NP_001341946 NP_001139740 NP_032835 Локус (UCSC) Chr 5: 150.11 – 150.16 Mb Chr 18: 61.18 – 61.22 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

PDGFRB (англ. Platelet-derived growth factor receptor beta; CD140b; КФ 2.7.10.1) — мембранный белок, рецепторная тирозинкиназа, продукт гена человека PDGFRB.

Ген PDGFRB расположен на 5-й хромосоме человека в позиции q32 (5q32), содержит 25 экзонов. Ген находится между генами рецепторов ГМ-КСФ и CSF1R на хромосомном участке, который может теряться в результате делеции, которая в результате приводит к развитию миелодиспластического 5q-синдрома^[5]. Среди прочих генетических нарушений PDGFRB, приводящих к различным злокачественным заболеваниям костного мозга, — небольшая делеция и транслокация, вызывающие слияние гена PDGFRBс одним из по крайней мере 30 генов, которое приводит к миелопролиферативной неоплазии с эозинофилией и связанным с этим позреждение органа с возможной прогрессией до агрессивной лейкемией^[6].

PDGFRB — белок из семейства рецепторных тирозинкиназ, относится к III типу этого семейства и структурно характеризуется наличием 5 внеклеточных иммуноглобулино-подобных доменов, единственным мембранным спиральным фрагментом и соседним внутриклеточным доменом, в котором соединены тирозинкиназный домен и C-конец белка^[7]. В отсутствие лиганда PDGFRβ находится в неактивной конформации, в которой активационная петля закрывает каталитический участок, при этом примембранный участок находится поверх петли, покрывая активный участок, а киназный домен покрыт C-концом. После связывания рецептора с лигандом тромбоцитарным фактором роста рецептор димеризуется, что высвобождает заингибированную конформацию благодаря аутофосфорилированию регуляторного тирозина противоположным мономером. Тирозины в положениях 857 и 751 — основные участки фосфорилирования при активации PDGFRβ^[8]. Молекулярная масса зрелого белка — 180 кДа.

PDGFRB играет важную роль в развитии сосудов. Удаление генов PDGFRB либо его лиганда тромбоцитарного фактора роста PDGF-B снижает количество перицитов и сосудистых гладкомышечных клеток и, таким образом, нарушает целостность и функциональность во многих органах, включая мозг, сердце, почки, кожу и глаза^{[9][10][11][12]}.

Клеточные исследования in vitro показали, что эндотелиальные клетки секретируют тромбоцитарный фактор роста, который рекрутирует PDGFRβ-экспрессирующие перициты, что стабилизирует насцентные кровеносные сосуды^[13]. У мышей, имеющих лишь одну аллель PDGFRB, наблюдается ряд фенотипических изменений, включая пониженную дифференциацию гладкомышечных клеток аорты и перицитов мозга, а также подавленную дифференцировку адипоцитов из перицитов и мезенхимальных клеток^[14]. Дисрегуляция киназной активности PDGFRβ (как правило, активация фермента) играет роль в развитии таких эндемичных заболеваний, как рак и сердечно-сосудистые заболевания^[15][16][17].

PDGFRβ взаимодействует со следующими белками: