GRIA3
GRIA3 | ||||
---|---|---|---|---|
Identificadores | ||||
Identificadores externos | ||||
Ortólogos | ||||
Especies |
| |||
Entrez |
| |||
RefSeq (ARNm) |
| |||
El receptor de glutamato 3 es una proteína codificada en humanos por el gen GRIA3.[1][2][3]
Función
[editar]Los receptores de glutamato son los receptores de neurotransmisores excitatorios predominantes en el cerebro de los mamíferos y se activan en una variedad de procesos neurofisiológicos normales. Estos receptores son complejos de proteínas hetermoméricas con múltiples subunidades, cada una de estas poseyendo regiones transmembranales, todo organizado para formar un canal iónico activado por ligandos. La clasificación de los canales de glutamato está basada en su activación por diferentes agonistas farmacológicos. Este gen pertenece a una familia de receptores alfa-amino-3-hidroxi-5-metil-4-isoxazol propionato (AMPA). El empalme alternativo de este lugar produce varias isoformas alternativas que pueden variar en sus propiedades de transmisión de señales.[3]
Interacciones
[editar]El GRIA3 ha mostrado capacidad de interacción con los genes GRIP1[4] y PICK1.[4]
Edición de RNA
[editar]Varios canales iónicos y receptores de neurotransmisores usan pre-RNAm como sustratos para ADARs.[5] Esto incluye cinco subunidades del receptor de glutamato: las subunidades del receptor AMPA ionotrópico Glur2, Glur3 y Glur4, y las subunidades de Receptor de kainato Glur5 y Glur6. Las compuertas iónicas de los receptores de glutamato están compuestas de cuatro subunidades por canal, con cada subunidad contribuyendo a la estructura del poro. La estructura del poro es similar a la que se encuentra en los canales de K+ (e.g. el canal Kv1.1).[6] El pre-ARNm del canal humano Kv1.1 también está sujeto a una edición de ARN de A a I.[7] La función de los receptores de glutamato es la mediación de neurotransmisores rápidos en el cerebro. La diversidad de las subunidades está determinada por eventos de edición del ARN de las subunidades individuales al igual que por el splicing de ARN. Por esta razón existe una gran variedad de estos receptores. El gen GluR3 es un producto del gen GRIA3 y su pre-ARNm es sujeto de edición de ARN.
Tipo
[editar]La edición de ARN de A a I es catalizada por una familia de adenosín deaminasas que actúan en el ARN (ADARs), que reconocen específicamente adenosinas dentro de las regiones de doble cadena del pre-ARNm y las deaminasas convirtiéndolas en inosina. Las inosinas son reconocidas como guanosinas por el aparato de traducción celular. Existen tres miembros de la familia ADAR, siendo ADAR1 y ADAR2 los únicos miembros enzimáticamente activos. Se cree que la ADAR3 cumple una función regulatoria en el cerebro. Las ADAR1 y ADAR2 se expresan ampliamente en todos los tejidos mientras que la ADAR3 está restringida al cerebro. Las regiones de ARN de doble cadena se forman por apareamiento de bases entre residuos en la región proximal del sitio de edición con residuos de un intrón cercano, pero pueden ocurrir en una secuencia exónica. La región que sufre el apareamiento de bases con la región de edición se denomina secuencia de edición complementaria (SEC).
Ubicación
[editar]El pre-ARNm de esta unidad se edita en una posición. La edición R/G se localiza en el exón 13 entre las regiones M3 y M4. La edición produce un cambio de codón de una arginina (AGA) a una glicina (GGA). La ubicación de la edición corresponde a un dominio de interacción bipartita de ligando en el receptor. El sitio R/G se encuentra en el aminoácido 769, inmediatamente antes de los módulos de 38 aminoácidos de flip y flop introducidos por el splicing alternativo. Las formas de flip y flop están presentes tanto en la forma editada como en la forma no editada de esta proteína.[8] La secuencia de edición complementaria (SEC) se encuentra en una secuencia intrónica cerca del exón. La secuencia intrónica incluye un sitio de sílice 5'. La región de doble cadena predicha es de 30 bases de longitud. El residuo de adenosina está mal apareado en la transcripción genómicamente codificada, pero este no es el caso después de la edición. A pesar de la existencia de secuencias similares a el sitio Q/R en el GluR-B, la edición en este sitio no ocurre en el pre-ARNm del Glur3. La edición hace que la adenosina objetivo, que está mal emparejada antes de la edición de la estructura de doble cadena de ARN, se aparee adecuadamente después de la edición. La secuencia intrónica contiene un sitio de sílice donador 5'.[8][9]
Conservación
[editar]La edición también ocurre en ratas.[8]
Regulación
[editar]Inicialmente, en estados embrionarios tempranos, la edición de GluR-3 en el cerebro de rata se da poco y progresa a niveles elevados cerca del nacimiento. En humanos, 80-90% de las transcripciones del GRIA3 son editadas.[8] La ausencia del sitio de edición Q/R en esta subunidad del receptor de glutamato se debe a la ausencia de las secuencias intrónicas necesarias para formar un dúplex.[10]
Consecuencias
[editar]Estructuralmente, la edición produce un cambio de codón de (AGA) a (GGA), un cambio de R a G en el sitio de edición.[8] Funcionalmente, la edición de un sitio R/G permite una recuperación más rápida de la desensibilización. El Glu-R sin edición en este sitio tiene tasas de tasas de recuperación más lentas. La edición, de esta manera, permite la respuesta permanente a los estímulos rápidos. Es muy posible que exista una interacción entre edición y splicing. La edición se da antes del splicing. Todos los receptores AMPA tienen variantes alternativas de flip y flop por splicing. Los receptores AMPA que tienen la forma flop se desensibilizan más rápido que los que tienen la forma flip.[8]
Véase también
[editar]Referencias
[editar]- ↑ McNamara JO, Eubanks JH, McPherson JD, Wasmuth JJ, Evans GA, Heinemann SF (Jul de 1992). «Chromosomal localization of human glutamate receptor genes». J Neurosci 12 (7): 2555-62. PMID 1319477.
- ↑ Gecz J, Barnett S, Liu J, Hollway G, Donnelly A, Eyre H, Eshkevari HS, Baltazar R, Grunn A, Nagaraja R, Gilliam C, Peltonen L, Sutherland GR, Baron M, Mulley JC (Mar de 2000). «Characterization of the human glutamate receptor subunit 3 gene (GRIA3), a candidate for bipolar disorder and nonspecific X-linked mental retardation». Genomics 62 (3): 356-68. PMID 10644433. doi:10.1006/geno.1999.6032.
- ↑ a b «Entrez Gene: GRIA3 glutamate receptor, ionotrophic, AMPA 3».
- ↑ a b Hirbec, Hélène; Perestenko Olga, Nishimune Atsushi, Meyer Guido, Nakanishi Shigetada, Henley Jeremy M, Dev Kumlesh K (mayo. de 2002). «The PDZ proteins PICK1, GRIP, and syntenin bind multiple glutamate receptor subtypes. Analysis of PDZ binding motifs». J. Biol. Chem. (United States) 277 (18): 15221-4. ISSN 0021-9258. PMID 11891216. doi:10.1074/jbc.C200112200.
- ↑ Bass BL (2002). «RNA editing by adenosine deaminases that act on RNA». Annu. Rev. Biochem. 71: 817-46. PMC 1823043. PMID 12045112. doi:10.1146/annurev.biochem.71.110601.135501.
- ↑ Seeburg PH, Single F, Kuner T, Higuchi M, Sprengel R (julio de 2001). «Genetic manipulation of key determinants of ion flow in glutamate receptor channels in the mouse». Brain Res. 907 (1-2): 233-43. PMID 11430906. doi:10.1016/S0006-8993(01)02445-3.
- ↑ Bhalla T, Rosenthal JJ, Holmgren M, Reenan R (octubre de 2004). «Control of human potassium channel inactivation by editing of a small mRNA hairpin». Nat. Struct. Mol. Biol. 11 (10): 950-6. PMID 15361858. doi:10.1038/nsmb825.
- ↑ a b c d e f Lomeli H, Mosbacher J, Melcher T, Höger T, Geiger JR, Kuner T, Monyer H, Higuchi M, Bach A, Seeburg PH (diciembre de 1994). «Control of kinetic properties of AMPA receptor channels by nuclear RNA editing». Science 266 (5191): 1709-13. PMID 7992055. doi:10.1126/science.7992055.
- ↑ Seeburg PH, Higuchi M, Sprengel R (mayo de 1998). «RNA editing of brain glutamate receptor channels: mechanism and physiology». Brain Res. Brain Res. Rev. 26 (2-3): 217-29. PMID 9651532. doi:10.1016/S0165-0173(97)00062-3.
- ↑ Herb A, Higuchi M, Sprengel R, Seeburg PH (marzo de 1996). «Q/R site editing in kainate receptor GluR5 and GluR6 pre-mRNAs requires distant intronic sequences». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (5): 1875-80. PMC 39875. PMID 8700852. doi:10.1073/pnas.93.5.1875.
Bibliografía
[editar]- Hollmann M, Hartley M, Heinemann S (1991). «Ca2+ permeability of KA-AMPA--gated glutamate receptor channels depends on subunit composition.». Science 252 (5007): 851-3. PMID 1709304. doi:10.1126/science.1709304.
- Rampersad V, Elliott CE, Nutt SL, et al. (1994). «Human glutamate receptor hGluR3 flip and flop isoforms: cloning and sequencing of the cDNAs and primary structure of the proteins.». Biochim. Biophys. Acta 1219 (2): 563-6. PMID 7918660.
- Rogers SW, Andrews PI, Gahring LC, et al. (1994). «Autoantibodies to glutamate receptor GluR3 in Rasmussen's encephalitis.». Science 265 (5172): 648-51. PMID 8036512. doi:10.1126/science.8036512.
- Tomiyama M, Rodriguez-Puertas R, Cortés R, et al. (1997). «Differential regional distribution of AMPA receptor subunit messenger RNAs in the human spinal cord as visualized by in situ hybridization.». Neuroscience 75 (3): 901-15. PMID 8951883. doi:10.1016/0306-4522(96)00321-1.
- Osten P, Srivastava S, Inman GJ, et al. (1998). «The AMPA receptor GluR2 C terminus can mediate a reversible, ATP-dependent interaction with NSF and alpha- and beta-SNAPs.». Neuron 21 (1): 99-110. PMID 9697855. doi:10.1016/S0896-6273(00)80518-8.
- Srivastava S, Osten P, Vilim FS, et al. (1998). «Novel anchorage of GluR2/3 to the postsynaptic density by the AMPA receptor-binding protein ABP.». Neuron 21 (3): 581-91. PMID 9768844. doi:10.1016/S0896-6273(00)80568-1.
- Hayashi T, Umemori H, Mishina M, Yamamoto T (1999). «The AMPA receptor interacts with and signals through the protein tyrosine kinase Lyn.». Nature 397 (6714): 72-6. PMID 9892356. doi:10.1038/16269.
- Amir R, Dahle EJ, Toriolo D, Zoghbi HY (2000). «Candidate gene analysis in Rett syndrome and the identification of 21 SNPs in Xq.». Am. J. Med. Genet. 90 (1): 69-71. PMID 10602120. doi:10.1002/(SICI)1096-8628(20000103)90:1<69::AID-AJMG12>3.0.CO;2-W.
- Aruscavage PJ, Bass BL (2000). «A phylogenetic analysis reveals an unusual sequence conservation within introns involved in RNA editing.». RNA 6 (2): 257-69. PMC 1369911. PMID 10688364. doi:10.1017/S1355838200991921.
- Gahring L, Carlson NG, Meyer EL, Rogers SW (2001). «Granzyme B proteolysis of a neuronal glutamate receptor generates an autoantigen and is modulated by glycosylation.». J. Immunol. 166 (3): 1433-8. PMID 11160179.
- Liu QJ, Gong YQ, Chen BX, et al. (2001). «[Linkage analysis and mutation detection of GRIA3 in Smith--Fineman--Myers syndrome]». Yi Chuan Xue Bao 28 (11): 985-90. PMID 11725645.
- Hirbec H, Perestenko O, Nishimune A, et al. (2002). «The PDZ proteins PICK1, GRIP, and syntenin bind multiple glutamate receptor subtypes. Analysis of PDZ binding motifs.». J. Biol. Chem. 277 (18): 15221-4. PMID 11891216. doi:10.1074/jbc.C200112200.
- Wyszynski M, Kim E, Dunah AW, et al. (2002). «Interaction between GRIP and liprin-alpha/SYD2 is required for AMPA receptor targeting.». Neuron 34 (1): 39-52. PMID 11931740. doi:10.1016/S0896-6273(02)00640-2.
- Tomiyama M, Rodríguez-Puertas R, Cortés R, et al. (2002). «Flip and flop splice variants of AMPA receptor subunits in the spinal cord of amyotrophic lateral sclerosis.». Synapse 45 (4): 245-9. PMID 12125045. doi:10.1002/syn.10098.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899-903. PMC 139241. PMID 12477932. doi:10.1073/pnas.242603899.
- Ganor Y, Besser M, Ben-Zakay N, et al. (2003). «Human T cells express a functional ionotropic glutamate receptor GluR3, and glutamate by itself triggers integrin-mediated adhesion to laminin and fibronectin and chemotactic migration.». J. Immunol. 170 (8): 4362-72. PMID 12682273.
- Flajolet M, Rakhilin S, Wang H, et al. (2004). «Protein phosphatase 2C binds selectively to and dephosphorylates metabotropic glutamate receptor 3.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100 (26): 16006-11. PMC 307683. PMID 14663150. doi:10.1073/pnas.2136600100.
- Kolleker A, Zhu JJ, Schupp BJ, et al. (2004). «Glutamatergic plasticity by synaptic delivery of GluR-B(long)-containing AMPA receptors.». Neuron 40 (6): 1199-212. PMID 14687553. doi:10.1016/S0896-6273(03)00722-0.
Enlaces externos
[editar]- MeSH: GRIA3+protein,+human (en inglés)
- http://darned.ucc.ie
- Esta obra contiene una traducción derivada de «GRIA3» de Wikipedia en inglés, publicada por sus editores bajo la Licencia de documentación libre de GNU y la Licencia Creative Commons Atribución-CompartirIgual 4.0 Internacional.