Zusammen mit Zwirrfinst suchen Gildenmeister Knuddeluff und Plaudagei weiter nach möglichen Dungeons, in denen ein Zahnrad der Zeit versteckt sein könnte. Dabei bekommen Bidiza, Sonnflora und Digdri den Auftrag, die Kristallhöhle zu erkunden. Doch bis auf einen Kristall, den Bidiza mit sich genommen hat, haben sie nichts weiter entdecken können. Aufgrund Zwirrfinsts Kombinationsgabe und dem Dimensionalen Schrei findet die Knuddeluff-Gilde heraus, dass sich dennoch ein Zahnrad der Zeit sowie das legendäre PokémonTobutz in der Kristallhöhle befinden müssen. Sogleich macht sich das Heldenteam auf den Weg.
Am Ende des Dungeons finden sie einen Raum mit drei Kristallsäulen vor. Durch Berühren können sie die Farben der Kristalle ändern, dies ist mit einem Rätsel verbunden. Als alle Kristalle blau sind, öffnet sich eine weitere Höhle, die Kristallstraße.