ZGPAT

ZGPAT
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4II1
Ідентифікатори
Символи	ZGPAT, GPATC6, GPATCH6, KIAA1847, ZC3H9, ZC3HDC9, ZIP, zinc finger CCCH-type and G-patch domain containing
Зовнішні ІД	MGI: 2449939 HomoloGene: 41874 GeneCards: ZGPAT
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв'язування з іоном металу; • nucleic acid binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• negative regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	84619
	229007
	ENSG00000197114
	ENSMUSG00000027582
	Q8N5A5
	Q8VDM1
NM_181485; NM_001083113; NM_001195653; NM_001195654; NM_032527;
	NM_181484
	NM_001048148; NM_144894
	NP_001076582; NP_001182582; NP_001182583; NP_115916; NP_852150
	NP_001041613; NP_659143
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ZGPAT (англ. Zinc finger CCCH-type and G-patch domain containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 531 амінокислот, а молекулярна маса — 57 359^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDEESLESAL	QTYRAQLQQV	ELALGAGLDS	SEQADLRQLQ	GDLKELIELT
EASLVSVRKS	SLLAALDEER	PGRQEDAEYQ	AFREAITEAV	EAPAAARGSG
SETVPKAEAG	PESAAGGQEE	EEGEDEEELS	GTKVSAPYYS	SWGTLEYHNA
MVVGTEEAED	GSAGVRVLYL	YPTHKSLKPC	PFFLEGKCRF	KENCRFSHGQ
VVSLDELRPF	QDPDLSSLQA	GSACLAKHQD	GLWHAARITD	VDNGYYTVKF
DSLLLREAVV	EGDGILPPLR	TEATESDSDS	DGTGDSSYAR	VVGSDAVDSA
QSSALCPSLA	VVGSDAVDSG	TCSSAFAGWE	VHTRGIGSRL	LTKMGYEFGK
GLGRHAEGRV	EPIHAVVLPR	GKSLDQCVET	LQKQTRVGKA	GTNKPPRCRG
RGARPGGRPA	PRNVFDFLNE	KLQGQAPGAL	EAGAAPAGRR	SKDMYHASKS
AKRALSLRLF	QTEEKIERTQ	RDIRSIQEAL	ARNAGRHSVA	SAQLQEKLAG
AQRQLGQLRA	QEAGLQQEQR	KADTHKKMTE	F

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 doi:10.1093/dnares/8.2.85
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Yu W., Li R., Gui B., Shang Y. (2010). sZIP, an alternative splice variant of ZIP, antagonizes transcription repression and growth inhibition by ZIP. J. Biol. Chem. 285: 14301—14307. PMID 20233718 doi:10.1074/jbc.M110.107508

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15948 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-23 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q8N5A5 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15948 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-23 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q8N5A5 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]