SFTPC

SFTPC
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2YAD
Ідентифікатори
Символи	SFTPC, BRICD6, PSP-C, SFTP2, SMDP2, SP-C, surfactant protein C, SP5
Зовнішні ІД	OMIM: 178620 MGI: 109517 HomoloGene: 2271 GeneCards: SFTPC
Пов'язані генетичні захворювання
	chronic respiratory distress with surfactant metabolism deficiency
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• extracellular region; • clathrin-coated endocytic vesicle; • lamellar granule; • endoplasmic reticulum membrane; • multivesicular body lumen; • міжклітинний простір;
Біологічний процес	• respiratory gaseous exchange by respiratory system;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	6440
	20389
	ENSG00000168484
	ENSMUSG00000022097
	P11686
	P21841; Q6P8P8
NM_001172357; NM_001172410; NM_003018; NM_001317778; NM_001317779;
	NM_001317780
	NM_011359
NP_001165828; NP_001165881; NP_001304707; NP_001304708; NP_001304709;
	NP_003009
	NP_035489
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SFTPC (англ. Surfactant protein C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 197 амінокислот, а молекулярна маса — 21 053^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDVGSKEVLM	ESPPDYSAAP	RGRFGIPCCP	VHLKRLLIVV	VVVVLIVVVI
VGALLMGLHM	SQKHTEMVLE	MSIGAPEAQQ	RLALSEHLVT	TATFSIGSTG
LVVYDYQQLL	IAYKPAPGTC	CYIMKIAPES	IPSLEALNRK	VHNFQMECSL
QAKPAVPTSK	LGQAEGRDAG	SAPSGGDPAF	LGMAVNTLCG	EVPLYYI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

Hatzis D., Deiter G., deMello D.E., Floros J. (1994). Human surfactant protein-C: genetic homogeneity and expression in RDS; comparison with other species. Exp. Lung Res. 20: 57—72. PMID 8181452 DOI:10.3109/01902149409064373
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lahti M., Marttila R., Hallman M. (2004). Surfactant protein C gene variation in the Finnish population -association with perinatal respiratory disease. Eur. J. Hum. Genet. 12: 312—320. PMID 14735158 DOI:10.1038/sj.ejhg.5201137
Rosen D.M., Waltz D.A. (2005). Hydroxychloroquine and surfactant protein C deficiency. N. Engl. J. Med. 352: 207—208. PMID 15647591 DOI:10.1056/NEJM200501133520223

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SFTPC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10802 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-22 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P11686 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з SFTPC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10802 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-22 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, P11686 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]