OGFOD1

OGFOD1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4NHX, 4NHY
Ідентифікатори
Символи	OGFOD1, TPA1, 2-oxoglutarate and iron dependent oxygenase domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 615857 MGI: 2442978 HomoloGene: 41238 GeneCards: OGFOD1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity; • L-ascorbic acid binding; • iron ion binding; • oxidoreductase activity; • dioxygenase activity; • GO:0050602 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen; • peptidyl-proline dioxygenase activity; • peptidyl-proline 3-dioxygenase activity; • зв'язування з іоном металу;
Клітинна компонента	• cytoplasmic stress granule; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• regulation of translational termination; • проліферація; • peptidyl-proline hydroxylation; • protein hydroxylation; • stress granule assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	55239
	270086
	ENSG00000087263
	ENSMUSG00000033009
	Q8N543
	Q3U0K8
NM_018233; NM_001324357; NM_001324358; NM_001324359; NM_001324360;
	NM_001324361; NM_001324362; NM_001324363
	NM_001093757; NM_177767
NP_001311286; NP_001311287; NP_001311288; NP_001311289; NP_001311290;
	NP_001311291; NP_001311292; NP_060703
	NP_001087226; NP_808435
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

OGFOD1 (англ. 2-oxoglutarate and iron dependent oxygenase domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 542 амінокислот, а молекулярна маса — 63 246^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNGKRPAEPG	PARVGKKGKK	EVMAEFSDAV	TEETLKKQVA	EAWSRRTPFS
HEVIVMDMDP	FLHCVIPNFI	QSQDFLEGLQ	KELMNLDFHE	KYNDLYKFQQ
SDDLKKRREP	HISTLRKILF	EDFRSWLSDI	SKIDLESTID	MSCAKYEFTD
ALLCHDDELE	GRRIAFILYL	VPPWDRSMGG	TLDLYSIDEH	FQPKQIVKSL
IPSWNKLVFF	EVSPVSFHQV	SEVLSEEKSR	LSISGWFHGP	SLTRPPNYFE
PPIPRSPHIP	QDHEILYDWI	NPTYLDMDYQ	VQIQEEFEES	SEILLKEFLK
PEKFTKVCEA	LEHGHVEWSS	RGPPNKRFYE	KAEESKLPEI	LKECMKLFRS
EALFLLLSNF	TGLKLHFLAP	SEEDEMNDKK	EAETTDITEE	GTSHSPPEPE
NNQMAISNNS	QQSNEQTDPE	PEENETKKES	SVPMCQGELR	HWKTGHYTLI
HDHSKAEFAL	DLILYCGCEG	WEPEYGGFTS	YIAKGEDEEL	LTVNPESNSL
ALVYRDRETL	KFVKHINHRS	LEQKKTFPNR	TGFWDFSFIY	YE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Saito K., Adachi N., Koyama H., Matsushita M. (2010). OGFOD1, a member of the 2-oxoglutarate and iron dependent dioxygenase family, functions in ischemic signaling. FEBS Lett. 584: 3340—3347. PMID 20579638 DOI:10.1016/j.febslet.2010.06.015
Wehner K.A., Schutz S., Sarnow P. (2010). OGFOD1, a novel modulator of eukaryotic translation initiation factor 2alpha phosphorylation and the cellular response to stress. Mol. Cell. Biol. 30: 2006—2016. PMID 20154146 DOI:10.1128/MCB.01350-09
Ahmad Y., Boisvert F.M., Lundberg E., Uhlen M., Lamond A.I. (2012). Systematic analysis of protein pools, isoforms, and modifications affecting turnover and subcellular localization. Mol. Cell. Proteomics. 11: M111.013680.01 — M111.013680.15. PMID 22002106 DOI:10.1074/mcp.M111.013680

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25585 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8N543 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25585 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q8N543 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]