EXO1

EXO1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3QE9, 3QEA, 3QEB
Ідентифікатори
Символи	EXO1, HEX1, hExoI, exonuclease 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606063 MGI: 1349427 HomoloGene: 31352 GeneCards: EXO1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• endonuclease activity; • double-stranded DNA 5'-3' exodeoxyribonuclease activity; • single-stranded DNA 5'-3' exodeoxyribonuclease activity; • DNA binding; • 5'-3' exonuclease activity; • nuclease activity; • RNA-DNA hybrid ribonuclease activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • 5'-3' exodeoxyribonuclease activity; • flap endonuclease activity; • chromatin binding; • exonuclease activity; • hydrolase activity, acting on ester bonds; • каталітична активність; • hydrolase activity; • зв'язування з іоном металу; • double-stranded DNA binding; • 5'-flap endonuclease activity;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • ядерні тільця; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• DNA recombination; • процес імунної системи; • humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin; • DNA mismatch repair; • cellular response to DNA damage stimulus; • somatic hypermutation of immunoglobulin genes; • GO:0007126 мейоз; • Перемикання класу імуноглобулінів; • GO:0100026 Репарація ДНК; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis; • реплікація ДНК; • t-circle formation; • meiotic DNA double-strand break processing; • regulation of signal transduction by p53 class mediator;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9156
	26909
	ENSG00000174371
	ENSMUSG00000039748
	Q9UQ84; Q5T397
	Q9QZ11
	NM_003686; NM_006027; NM_130398; NM_001319224
	NM_012012
	NP_001306153; NP_003677; NP_006018; NP_569082
	NP_036142
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EXO1 (англ. Exonuclease 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 846 амінокислот, а молекулярна маса — 94 103^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGIQGLLQFI	KEASEPIHVR	KYKGQVVAVD	TYCWLHKGAI	ACAEKLAKGE
PTDRYVGFCM	KFVNMLLSHG	IKPILVFDGC	TLPSKKEVER	SRRERRQANL
LKGKQLLREG	KVSEARECFT	RSINITHAMA	HKVIKAARSQ	GVDCLVAPYE
ADAQLAYLNK	AGIVQAIITE	DSDLLAFGCK	KVILKMDQFG	NGLEIDQARL
GMCRQLGDVF	TEEKFRYMCI	LSGCDYLSSL	RGIGLAKACK	VLRLANNPDI
VKVIKKIGHY	LKMNITVPED	YINGFIRANN	TFLYQLVFDP	IKRKLIPLNA
YEDDVDPETL	SYAGQYVDDS	IALQIALGNK	DINTFEQIDD	YNPDTAMPAH
SRSHSWDDKT	CQKSANVSSI	WHRNYSPRPE	SGTVSDAPQL	KENPSTVGVE
RVISTKGLNL	PRKSSIVKRP	RSAELSEDDL	LSQYSLSFTK	KTKKNSSEGN
KSLSFSEVFV	PDLVNGPTNK	KSVSTPPRTR	NKFATFLQRK	NEESGAVVVP
GTRSRFFCSS	DSTDCVSNKV	SIQPLDETAV	TDKENNLHES	EYGDQEGKRL
VDTDVARNSS	DDIPNNHIPG	DHIPDKATVF	TDEESYSFES	SKFTRTISPP
TLGTLRSCFS	WSGGLGDFSR	TPSPSPSTAL	QQFRRKSDSP	TSLPENNMSD
VSQLKSEESS	DDESHPLREE	ACSSQSQESG	EFSLQSSNAS	KLSQCSSKDS
DSEESDCNIK	LLDSQSDQTS	KLRLSHFSKK	DTPLRNKVPG	LYKSSSADSL
STTKIKPLGP	ARASGLSKKP	ASIQKRKHHN	AENKPGLQIK	LNELWKNFGF
KKDSEKLPPC	KKPLSPVRDN	IQLTPEAEED	IFNKPECGRV	QRAIFQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мейоз, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

Qiu J., Qian Y., Chen V., Guan M.-X., Shen B. (1999). Human exonuclease 1 functionally complements its yeast homologues in DNA recombination, RNA primer removal, and mutation avoidance. J. Biol. Chem. 274: 17893—17900. PMID 10364235 doi:10.1074/jbc.274.25.17893
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Lee B.-I., Wilson D.M. III (1999). The RAD2 domain of human exonuclease 1 exhibits 5' to 3' exonuclease and flap structure-specific endonuclease activities. J. Biol. Chem. 274: 37763—37769. PMID 10608837 doi:10.1074/jbc.274.53.37763
Schmutte C., Sadoff M.M., Shim K.-S., Acharya S., Fishel R. (2001). The interaction of DNA mismatch repair proteins with human exonuclease I. J. Biol. Chem. 276: 33011—33018. PMID 11427529 doi:10.1074/jbc.M102670200
Genschel J., Bazemore L.R., Modrich P. (2002). Human exonuclease I is required for 5' and 3' mismatch repair. J. Biol. Chem. 277: 13302—13311. PMID 11809771 doi:10.1074/jbc.M111854200
Lee B.-I., Nguyen L.H., Barsky D., Fernandes M., Wilson D.M. III (2002). Molecular interactions of human Exo1 with DNA. Nucleic Acids Res. 30: 942—949. PMID 11842105 doi:10.1093/nar/30.4.942

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3511 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UQ84 (англ.) . Архів оригіналу за 23 листопада 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3511 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9UQ84 (англ.) . Архів оригіналу за 23 листопада 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]