DEFB1

DEFB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1E4S, 1IJU, 1IJV, 1KJ5, 2NLB, 2NLC, 2NLD, 2NLE, 2NLF, 2NLG, 2NLH, 2NLP, 2NLQ, 2NLS, 2PLZ
Ідентифікатори
Символи	DEFB1, BD1, DEFB-1, DEFB101, HBD1, defensin beta 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602056 MGI: 1096878 HomoloGene: 88476 GeneCards: DEFB1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• CCR6 chemokine receptor binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• Golgi lumen; • extracellular region; • екзосома; • sperm midpiece; • міжклітинний простір; • extrinsic component of membrane; • microvesicle; • мембрана;
Біологічний процес	• хемотаксис; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • defense response; • innate immune response in mucosa; • acute inflammatory response; • response to bacterium; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • response to testosterone; • positive regulation of flagellated sperm motility involved in capacitation; • defense response to bacterium; • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source; • cAMP-mediated signaling; • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium; • antimicrobial humoral response; • вроджений імунітет; • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1672
	13214
	ENSG00000164825; ENSG00000284881
	ENSMUSG00000044748
	P60022
	P56386
	NM_005218
	NM_007843
	NP_005209
	NP_031869
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DEFB1 (англ. Defensin beta 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 68 амінокислот, а молекулярна маса — 7 420^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRTSYLLLFT		LCLLLSEMAS		GGNFLTGLGH		RSDHYNCVSS		GGQCLYSACP
IFTKIQGTCY		RGKAKCCK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

Liu L., Zhao C., Heng H.H.Q., Ganz T. (1997). The human beta-defensin-1 and alpha-defensins are encoded by adjacent genes: two peptide families with differing disulfide topology share a common ancestry. Genomics. 43: 316—320. PMID 9268634 doi:10.1006/geno.1997.4801
McCray P.B. Jr., Bentley L. (1997). Human airway epithelia express a beta-defensin. Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 16: 343—349. PMID 9070620 doi:10.1165/ajrcmb.16.3.9070620
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Bensch K.W., Raida M., Maegert H.-J., Schulz-Knappe P., Forssmann W.-G. (1995). hBD-1: a novel beta-defensin from human plasma. FEBS Lett. 368: 331—335. PMID 7628632 doi:10.1016/0014-5793(95)00687-5
Kluever E., Schulz A., Forssmann W.-G., Adermann K. (2002). Chemical synthesis of beta-defensins and LEAP-1/hepcidin. J. Pept. Res. 59: 241—248. PMID 12010514 doi:10.1034/j.1399-3011.2002.00980.x
Hoover D.M., Chertov O., Lubkowski J. (2001). The structure of human beta-defensin-1: new insights into structural properties of beta-defensins. J. Biol. Chem. 276: 39021—39026. PMID 11486002 doi:10.1074/jbc.M103830200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2766 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-02 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P60022 (англ.) . Архів оригіналу за 31 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2766 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-02 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P60022 (англ.) . Архів оригіналу за 31 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]