CNOT4

CNOT4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1E4U, 1UR6
Ідентифікатори
Символи	CNOT4, CLONE243, NOT4, NOT4H, CCR4-NOT transcription complex subunit 4
Зовнішні ІД	OMIM: 604911 MGI: 1859026 HomoloGene: 40870 GeneCards: CNOT4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • зв'язування з іоном металу; • transferase activity; • RNA binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • цитоплазма; • CCR4-NOT complex; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• Убіквітин-залежний протеоліз; • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening; • protein autoubiquitination; • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • regulation of megakaryocyte differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	4850
	53621
	ENSG00000080802
	ENSMUSG00000038784
	O95628
	Q8BT14
NM_001008225; NM_001190847; NM_001190848; NM_001190849; NM_001190850;
	NM_013316; NM_001393370; NM_001393371; NM_001393372; NM_001393373; NM_001393374; NM_001393375
	NM_001164411; NM_001164412; NM_001164413; NM_001164414; NM_016877
NP_001008226; NP_001177776; NP_001177777; NP_001177778; NP_001177779;
	NP_037448
	NP_001157883; NP_001157884; NP_001157885; NP_001157886; NP_058573
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CNOT4 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 575 амінокислот, а молекулярна маса — 63 510^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRSPDAKED	PVECPLCMEP	LEIDDINFFP	CTCGYQICRF	CWHRIRTDEN
GLCPACRKPY	PEDPAVYKPL	SQEELQRIKN	EKKQKQNERK	QKISENRKHL
ASVRVVQKNL	VFVVGLSQRL	ADPEVLKRPE	YFGKFGKIHK	VVINNSTSYA
GSQGPSASAY	VTYIRSEDAL	RAIQCVNNVV	VDGRTLKASL	GTTKYCSYFL
KNMQCPKPDC	MYLHELGDEA	ASFTKEEMQA	GKHQEYEQKL	LQELYKLNPN
FLQLSTGSVD	KNKNKVTPLQ	RYDTPIDKPS	DSLSIGNGDN	SQQISNSDTP
SPPPGLSKSN	PVIPISSSNH	SARSPFEGAV	TESQSLFSDN	FRHPNPIPSG
LPPFPSSPQT	SSDWPTAPEP	QSLFTSETIP	VSSSTDWQAA	FGFGSSKQPE
DDLGFDPFDV	TRKALADLIE	KELSVQDQPS	LSPTSLQNSS	SHTTTAKGPG
SGFLHPAAAT	NANSLNSTFS	VLPQRFPQFQ	QHRAVYNSFS	FPGQAARYPW
MAFPRNSIMH	LNHTANPTSN	SNFLDLNLPP	QHNTGLGGIP	VAGEEEVKVS
TMPLSTSSHS	LQQGQQPTSL	HTTVA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7880 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O95628 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7880 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O95628 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]