Preskočiť na obsah

PYLIS sekvencia

z Wikipédie, slobodnej encyklopédie
Predikovaná sekundárna štruktúra PYLIS sekvencie

Ako PYLIS sekvencia[chýba zdroj] (PYLIS: pyrrolysine insertion sequence) sa v molekulárnej biológii označuje vlásenková štruktúra, ktorá je prítomná v niektorých sekvenciách mRNA. Kedysi sa predpokladalo, že tento štruktúrny motív spôsobuje, že sa stop kodón UAG (amber) prekladá na aminokyselinu pyrolyzín namiesto ukončenia translácie.[1][2][3] Tento proces by bol analogický k SECIS elementu, ktorý signalizuje vloženie selenocysteínu namiesto UGA (opal) stop kodónu. Bolo však ukázané, že prítomnosť PYLIS nemá u modifikovanej E. coli žiadny efekt na účinnosť potlačenia funkcie UAG ako stop kodónu,[4] takže je vlastne pomenovanie tejto sekvencie nesprávne.

Referencie

[upraviť | upraviť zdroj]
  1. Reprogrammed genetic decoding in cellular gene expression. Molecular Cell, 2004, s. 157–168. DOI10.1016/S1097-2765(04)00031-0. PMID 14759362.
  2. Evidence for the existence in mRNAs of a hairpin element responsible for ribosome dependent pyrrolysine insertion into proteins. Biochimie, 2005, s. 813–817. DOI10.1016/j.biochi.2005.03.006. PMID 16164991.
  3. Pyrrolysine and selenocysteine use dissimilar decoding strategies. J. Biol. Chem., May 2005, s. 20740–20751. DOI10.1074/jbc.M501458200. PMID 15788401.
  4. Adding pyrrolysine to the Escherichia coli genetic code. FEBS Letters, November 2007, s. 5282–5288. DOI10.1016/j.febslet.2007.10.022. PMID 17967457.

Literatúra

[upraviť | upraviť zdroj]

Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku PYLIS downstream sequence na anglickej Wikipédii.