PYLIS sekvencia
Ako PYLIS sekvencia[chýba zdroj] (PYLIS: pyrrolysine insertion sequence) sa v molekulárnej biológii označuje vlásenková štruktúra, ktorá je prítomná v niektorých sekvenciách mRNA. Kedysi sa predpokladalo, že tento štruktúrny motív spôsobuje, že sa stop kodón UAG (amber) prekladá na aminokyselinu pyrolyzín namiesto ukončenia translácie.[1][2][3] Tento proces by bol analogický k SECIS elementu, ktorý signalizuje vloženie selenocysteínu namiesto UGA (opal) stop kodónu. Bolo však ukázané, že prítomnosť PYLIS nemá u modifikovanej E. coli žiadny efekt na účinnosť potlačenia funkcie UAG ako stop kodónu,[4] takže je vlastne pomenovanie tejto sekvencie nesprávne.
Referencie
[upraviť | upraviť zdroj]- ↑ Reprogrammed genetic decoding in cellular gene expression. Molecular Cell, 2004, s. 157–168. DOI: 10.1016/S1097-2765(04)00031-0. PMID 14759362.
- ↑ Evidence for the existence in mRNAs of a hairpin element responsible for ribosome dependent pyrrolysine insertion into proteins. Biochimie, 2005, s. 813–817. DOI: 10.1016/j.biochi.2005.03.006. PMID 16164991.
- ↑ Pyrrolysine and selenocysteine use dissimilar decoding strategies. J. Biol. Chem., May 2005, s. 20740–20751. DOI: 10.1074/jbc.M501458200. PMID 15788401.
- ↑ Adding pyrrolysine to the Escherichia coli genetic code. FEBS Letters, November 2007, s. 5282–5288. DOI: 10.1016/j.febslet.2007.10.022. PMID 17967457.
Literatúra
[upraviť | upraviť zdroj]- In vivo contextual requirements for UAG translation as pyrrolysine. Mol. Microbiol., January 2007, s. 229–241. DOI: 10.1111/j.1365-2958.2006.05500.x. PMID 17140411.
- THEIL HAVE, C; Zambach, S; Christiansen, H. Effects of using coding potential, sequence conservation and mRNA structure conservation for predicting pyrrolysine containing genes. BMC Bioinformatics, April 4, 2013, s. 118. DOI: 10.1186/1471-2105-14-118. PMID 23557142.
Zdroj
[upraviť | upraviť zdroj]Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku PYLIS downstream sequence na anglickej Wikipédii.