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Estrutura secundária da proteína

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Estutura Secundária.

A estrutura secundária da proteína é a forma tridimensional de segmentos locais de proteínas. Os dois elementos estruturais secundários mais comuns são as hélices alfa e as folhas-beta, embora também ocorram voltas beta e voltas ômega. Os elementos da estrutura secundária normalmente se formam espontaneamente como intermediários antes que a proteína se dobre em sua estrutura terciária tridimensional.

A estrutura secundária é formalmente definida pelo padrão de ligações de hidrogênio entre os átomos de hidrogênio amino e oxigênio carboxílico na cadeia principal do peptídeo. A estrutura secundária pode, alternativamente, ser definida com base no padrão regular de ângulos diedros da espinha dorsal em uma determinada região do gráfico de Ramachandran.

O conceito de estrutura secundária foi introduzido pela primeira vez por Kaj Ulrik Linderstrøm-Lang, da Universidade de Stanford, em 1952. [1] [2] Outros tipos de biopolímeros, como os ácidos nucléicos, também possuem estruturas secundárias características.

Características estruturais das três principais formas de hélices de proteínas [3] [4]
Atributo de geometria α-hélice 310 hélice π-hélice
Resíduos por turno 3.6 3,0 4.4
Tradução por resíduo 1.5 Å (0.15 nm) 2.0 Å (0.20 nm) 1.1 Å (0.11 nm)
Raio da hélice 2.3 Å (0.23 nm) 1.9 Å (0.19 nm) 2.8 Å (0.28 nm)

Ângulo

5.4 Å (0.54 nm) 6.0 Å (0.60 nm) 4.8 Å (0.48 nm)
  1. Linderstrøm-Lang KU (1952). Lane Medical Lectures: Proteins and Enzymes. [S.l.]: Stanford University Press. 115 páginas. ASIN B0007J31SC 
  2. Schellman JA, Schellman CG (1997). «Kaj Ulrik Linderstrøm-Lang (1896–1959)». Protein Sci. 6 (5): 1092–100. PMC 2143695Acessível livremente. PMID 9144781. doi:10.1002/pro.5560060516. He had already introduced the concepts of the primary, secondary, and tertiary structure of proteins in the third Lane Lecture (Linderstram-Lang, 1952) 
  3. Steven Bottomley (2004). «Interactive Protein Structure Tutorial». Consultado em 9 de janeiro de 2011. Arquivado do original em 1 de março de 2011 
  4. Schulz, G. E. (Georg E.), 1939- (1979). Principles of protein structure. New York: Springer-Verlag. ISBN 0-387-90386-0. OCLC 4498269