O Campeonato Sergipano de Futebol de 1939 foi a 16º edição da divisão principal do campeonato estadual de Sergipe. O campeão foi o Ipiranga de Maruim que conquistou o primeiro dos dois títulos estaduais da história do clube. O Ipiranga voltaria a conquistar novamente o Campeonato Sergipano de 1945. Foi a primeira vez que um clube do interior foi campeão estadual em Sergipe.
