Aparecen una segunda vez en la misma Cueva Electrorroca, acompañan al jugador a cruzar un puente y le dicen que baje por las escaleras donde allí lo esperan los Soldados del Equipo Plasma para detenerlo.
En el Palacio de N. Primero uno de ellos invita al jugador a entrar al cuarto de juegos de niño de N y el otro le indica que suba una escalera para llegar a él.
El Trío Sombrío, aún le sigue siendo fiel a su amo y líder, el gran Ghechis y al descubrir que volvió a las andadas con sus planes de robar a los Pokémon de todo el mundo, ellos se le unieron, dado a que juraron estar sirviéndole por la eternidad a él.
Aparecen en muchas ocasiones, luchando o apoyando al ejecutivo nuevo del Equipo Plasma, Menek, aunque en varias ocasiones se nieguen a obedecerle.
Después de pasar la Liga Pokémon, los tres se encontrarán en Ciudad Teja y se podrá luchar contra ellos una vez por mes o estación a distintos tipos de batalla (individuales, triples y rotativas).
Los minisprites de Ghechis, el Trío Sombrío, Acromo y N, poseen una animación que los caracteriza de los demás entrenadores: el Trío Sombrío aparece y desaparece como ninjas.
El Trío Sombrío son los únicos miembros del Equipo Plasma que no han aparecido en el anime.
