Puchar Ekstraklasy 2006/2007 – turniej piłkarski w Polsce mający na celu wyłonienie zdobywcy Pucharu Ekstraklasy w sezonie 2006/2007. W rozgrywkach brało udział 16 drużyn występujących w bieżącym sezonie w Orange Ekstraklasie.
Pierwszy terminarz 30 spotkań ogłoszony został pod koniec maja 2006[1]. Turniej miał rozpocząć się 9 września i być rozegrany w dwumeczach systemem pucharowym w następujących etapach: 1/8 finału, ćwierć- i półfinały oraz mecze finałowe. Do następnej rundy awansować mieli zwycięzcy poszczególnych dwumeczów.
Organizator turnieju nie zdołał rozpocząć rozgrywek w podanych terminach, nie są znane także oficjalne przyczyny takiego stanu rzeczy.
Pierwsza runda turnieju rozpoczęła się 21 listopada i rozgrywana była w systemie ligowym. Następnie ćwierć- i półfinały w dwumeczach systemem pucharowym natomiast finał odbył się 10 czerwca2007 na neutralnym stadionie.
W listopadzie 2006Telewizja Polsat S.A. i Ekstraklasa S.A. podpisały umowę nabycia wyłącznych praw do transmisji telewizyjnych meczów Pucharu Ekstraklasy przez trzy kolejne sezony – 2006/2007, 2007/2008 i 2008/2009. Mecze były transmitowane w kanałach Polsat, Polsat Sport i TV4.
Ćwierćfinały zaplanowano na 29/30 maja oraz 1/3 czerwca, półfinały – 5/6 i 8/9 czerwca, zaś finał na 12 czerwca2007. Mecz finałowy zostanie rozegrany na stadionie, wytypowanym przez Ekstraklasę SA.
Początkowo mecz finałowy miał być rozegrany na boisku neutralnym. Jednakże organizator rozgrywek Ekstraklasa S.A. zdecydował, że odbędzie się on na stadionie BOT-u w Bełchatowie.