Coronaviridae
Coronaviridae | |
---|---|
Animacija SARS-CoV-2 Viriona | |
Klasifikacija virusa | |
Skupina virusa: | Riboviria |
Carstvo: | Orthornavirae |
Koljeno: | Pisuviricota |
Razred: | Pisoniviricetes |
Red: | Nidovirales |
Podred: | Cornidovirineae |
Porodica: | Coronaviridae |
Rodovi[1] | |
Sinonimi | |
Baze podataka | |
Coronaviridae je porodica virusa s virusnom ovojnicom ili perikapsidom i genomom kojeg čini pozitivno orijentiran jednostruki RNK lanac. Skupinu čine podskupine Letovirinae i Orthocoronavirinae. Virusi iz tih skupina napadaju vodozemce, ptice i sisavce.
Virusni genom je duljine 26–32 kilobaze. Čestice su obično ukrašene velikim (~ 20 nm) površinskim izbočenjima u obliku latica ("peplomeri" ili "šiljci"), koji u elektronskim mikrografima sfernih čestica stvaraju sliku koja podsjeća na sunčevu koronu.
5 'i 3' krajevi genoma imaju poklopac, odnosno poli (A) trakt. Virusna ovojnica, dobivena pucanjem kroz membrane endoplazmatskog retikuluma (ER) ili Golgijeva aparata, uvijek sadrži dvije vrste proteina specifične za virus (gliko), S i M. Glikoprotein S sadrži velike površinske izbočine, dok je M trostruka, protežu transmembranski protein. Torovirusi i odabrana podskupina koronavirusa (posebno pripadnici podskupine A u rodu Betacoronavirus) imaju, osim peplomera sastavljenih od S, drugu vrstu površinskih izbočina sastavljenih od proteina hemaglutinin-esteraze. Drugi važan strukturni protein je fosfoprotein N, koji je odgovoran za spiralnu simetriju nukleokapsida koji zatvara genomsku RNK.[4]
Porodica Coronaviridae organizirana je u dvije podskupine, 5 rodova, 23 podroda i oko 40 vrsta:[5]
- Coronaviridae
- Orthocoronavirinae
- Letovirinae
- Alphaletovirus
- Alphacoronavirus
- Betacoronavirus
- Embecovirus
- Hibecovirus
- Merbecovirus
- Nobecovirus
- Sarbecovirus
- SARSr-CoV (Teški akutni respiratorni sindrom povezan coronavirus)
- SARS-CoV (Teški akutni respiratorni sindrom coronavirus)
- SARS-CoV-2 (Teški akutni respiratorni sindrom coronavirus 2)
- SARSr-CoV (Teški akutni respiratorni sindrom povezan coronavirus)
- Gammacoronavirus
- Deltacoronavirus
- ↑ Virus Taxonomy: 2018b Release (html). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (engleski). Ožujak 2019. Inačica izvorne stranice arhivirana 4. ožujka 2018. Pristupljeno 24. siječnja 2020.
- ↑ 2017.012-015S (xlsx). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (engleski). Listopad 2018. Inačica izvorne stranice arhivirana 14. svibnja 2019. Pristupljeno 24. siječnja 2020.
- ↑ McBride R, van Zyl M, Fielding BC. Kolovoz 2014. The coronavirus nucleocapsid is a multifunctional protein. Viruses. 6 (8): 2991–3018. doi:10.3390/v6082991. PMC 4147684. PMID 25105276
- ↑ Virus Taxonomy: 2018 Release. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (engleski). Listopad 2018. Inačica izvorne stranice arhivirana 20. ožujka 2020. Pristupljeno 24. siječnja 2019.