Open Tree of Life

Open Tree of Life
Información general
Dominio	opentreeoflife.org
Tipo	Sitio web
Licencia	BSD 2-clause (FreeBSD)
Estado actual	Activo
Gestión
Lanzamiento	2015
	[editar datos en Wikidata]

El Open Tree of Life es un árbol filogenético de la vida en línea, un esfuerzo colaborativo, financiado por la National Science Foundation.^[2]^[3] El primer borrador, que incluye 2,3 millones de especies, se publicó en septiembre de 2015.^[4] El gráfico interactivo permite al usuario acercarse a clasificaciones taxonómicas, árboles filogenéticos e información sobre un nodo. Al hacer clic en una especie, se devolverá su taxonomía de origen y referencia.

El árbol de la vida en el nodo Eukaryota

Acercamiento

El proyecto utiliza un enfoque de superárbol para generar un único árbol filogenético^[5] a partir de una taxonomía completa y un conjunto curado de estimaciones filogenéticas publicadas.

La taxonomía es una combinación de varias clasificaciones grandes producidas por otros proyectos; se crea usando una herramienta de software llamada "smasher"^[6] La taxonomía resultante se llama una taxonomía de árbol abierto (Open Tree Taxonomy, OTT) y se puede navegar en línea.^[7]

Historia

El proyecto se inició en junio de 2012 con un premio NSF de tres años a investigadores de diez universidades. En 2015, se otorgó un premio complementario de dos años a los investigadores de tres instituciones.

Véase también

Proyecto web Árbol de la vida

Referencias

↑ «OpenTreeOfLife License».
↑ Hinchliff, Cody E.; Smith, Stephen A.; Allman, James F.; Burleigh, J. Gordon; Chaudhary, Ruchi; Coghill, Lyndon M.; Crandall, Keith A.; Deng, Jiabin et al. (13 de octubre de 2015). «Synthesis of phylogeny and taxonomy into a comprehensive tree of life». Proceedings of the National Academy of Sciences (en inglés) 112 (41): 12764-12769. ISSN 0027-8424. doi:10.1073/pnas.1423041112.
↑ «Assembling, Visualizing, and Analyzing the Tree of Life». National Science Foundation (NSF). Consultado el 11 de febrero de 2016.
↑ Pennisi, Elizabeth (21 de septiembre de 2015). «First comprehensive tree of life shows how related you are to millions of species». Science Magazine.
↑ <mtholder@gmail.com>, Open Tree of Life developers. «opentree».
↑ «Automated assembly of a reference taxonomy for phylogenetic data synthesis». Biodiversity Data Journal 5 (5): e12581. 2017. PMC 5515096. PMID 28765728. doi:10.3897/BDJ.5.e12581.
↑ «tree.opentreeoflife.org».

Datos: Q22661281

[1] «OpenTreeOfLife License».

[2] Hinchliff, Cody E.; Smith, Stephen A.; Allman, James F.; Burleigh, J. Gordon; Chaudhary, Ruchi; Coghill, Lyndon M.; Crandall, Keith A.; Deng, Jiabin et al. (13 de octubre de 2015). «Synthesis of phylogeny and taxonomy into a comprehensive tree of life». Proceedings of the National Academy of Sciences (en inglés) 112 (41): 12764-12769. ISSN 0027-8424. doi:10.1073/pnas.1423041112.

[3] «Assembling, Visualizing, and Analyzing the Tree of Life». National Science Foundation (NSF). Consultado el 11 de febrero de 2016.

[4] Pennisi, Elizabeth (21 de septiembre de 2015). «First comprehensive tree of life shows how related you are to millions of species». Science Magazine.

[5] <mtholder@gmail.com>, Open Tree of Life developers. «opentree».

[6] «Automated assembly of a reference taxonomy for phylogenetic data synthesis». Biodiversity Data Journal 5 (5): e12581. 2017. PMC 5515096. PMID 28765728. doi:10.3897/BDJ.5.e12581.

[7] «tree.opentreeoflife.org».

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