Cyklický peptid

Cyklické peptidy (též cyklopeptidy) jsou polypeptidy, které mají v molekule uzavřený řetězec vazeb. Ten může vzniknout spojením aminového a karboxylového konce (například cyklosporin), mezi aminokoncem a postranním řetězcem (bacitracin…), mezi karboxylovým koncem a postranním řetězcem (zde je příkladem kolistin) nebo dvou postranních řetězců či složitějším způsobem (amanitiny). Velké množství cyklických peptidů bylo objeveno v přírodě a mnoho dalších bylo vyrobeno v laboratořích. Délka jejich řetězců se pohybuje od dvou až po stovky aminokyselinových zbytků. Přírodní cyklopeptidy mají často antimikrobiální či toxické účinky; v lékařství mají řadu využití, například jako antibiotika a imunosupresiva.^[1] Jsou značně odolné vůči trávicím enzymům, kvůli čemuž mohou v trávicím ústrojí zůstat po dlouhou dobu.

Cyklopeptidy mohou být klasifikovány podle typů vazeb, které utvářejí kruh:

• Homodetické cyklopeptidy, například cyklosporin A, jsou takové, u nichž je kruh tvořen výhradně klasickými peptidovými vazbami (například mezi alfa karboxylovou skupinou jednoho a aminoskupinou druhého zbytku). Nejjednoduššími příklady jsou 2,5-diketopiperaziny^[2] odvozené cyklizací dipeptidů.
• Cyklické isopeptidy obsahují nejméně jednu jinou než alfaamidovou vazbu, například mezi postrnním řetězcem jednoho zbytku a alfakarboxylem druhého, jako je tomu u mikrocystinu a bacitracinu.
• Cyklické depsipeptidy , jako například aureobasidin A a HUN-7293, mají alespoň jednu laktonovou (esterovou) vazbu místo amidové vazby. Některé cyklické depsipeptidy jsou cyklizovány spojením karboxylové skupiny na C-konci a postranním řetězcem threoninu nebo serinu, sem patří mimo jiné kahalalid F, theonellapeptolid a didemnin B.
• Bicyklické peptidy jako jsou amatoxiny amanitiny a faloidin obsahují můstkovou skupinu, obvykle metzi dvěma postranními řetězci. U amatoxinů je tento můstek tvořen thioetherovou vazbou mezi zbytky tryptofanu a cysteinu. K bicyklickým peptidům rovněž patří echinomycin, triostin A a celogentin C. Existuje řada cyklopeptidických hormonů, které jsou cyklizovány disulfidovými vazbami mezi dvěma cysteiny, například somatostatin a oxytocin.

• Amanitiny
• Bacitracin
• Cyklosporin
• Gramicidin S
• Kolistin
• Mikrocystiny
• Oktreotid
• Vankomycin

• Neribozomální peptid

• Obrázky, zvuky či videa k tématu Cyklický peptid na Wikimedia Commons

V tomto článku byl použit překlad textu z článku Cyclic peptide na anglické Wikipedii.