CKAP2
| CKAP2 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | CKAP2 | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | OMIM: 611569 MGI: 1931797 HomoloGene: 10070 GeneCards: CKAP2 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 13: 52.46 – 52.48 Mb | Chr 8: 22.66 – 22.68 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Citoskeletno pridruženi protein 2 je protein koji je kod ljudi kodiran genom CKAP2.[5][6]
Metodom fluorescentne hibridizacije in situ, Maouche-Chretien et al. (1998) mapirali su gen CKAP2 na heomosomu 13, sekvenca 13q14.[7]
Ljudski gen CKAP2, čija je cDNK poznata kao LB1, je protein povezan sa citoskelet om, uključen u progresiju mitoze. Njegova visoka transkripcijska aktivnost primijećena je u sjemenicia, timusu i difuznim B-ćelijskim limfomima. Gen kodira protein od 683 ostatka, kojem nedostaje homologija za poznate aminokiselinske sekvence. Na osnovu analize imunofluorescencije, proizvod CKAP2 je citoplazmatski protein, povezan sa citoskeletnim vlaknima.
Preuređenja regije 13q14 rezultiraju različitim tumorima. Tako su otkrivene delecije u multimplim mijelomima, rak prostate, karcinom pločastih ćelija glave i vrata, prolimfocitna leukemija B-ćelija, ne-Hodgkinov limfom, t u više od polovine slučajeva hronične limfocitne leukemije B-ćelija.
Aminokiselinska sekvenca
[uredi | uredi izvor]Dužina polipeptidnog lanca je 683 aminokiseline, a molekulska težina 76.987 Da.[8].
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MSTPAVPQDL | QLPPSQRAQS | AFKEQRRQKL | KEHLLRRKTL | FAYKQENEML | ||||
| SSSRDQRVVT | SEDQVQEGTK | VLKLKTKMAD | KENMKRPAES | KNNTVVGKHC | ||||
| IPLKPSNELT | NSTVVIDTHK | PKDSNQTPHL | LLTEDDPQSQ | HMTLSQAFHL | ||||
| KNNSKKKQMT | TEKQKQDANM | PKKPVLGSYR | GQIVQSKINS | FRKPLQVKDE | ||||
| SSAATKKLSA | TIPKATKPQP | VNTSSVTVKS | NRSSNMTATT | KFVSTTSQNT | ||||
| QLVRPPIRSH | HSNTRDTVKQ | GISRTSANVT | IRKGPHEKEL | LQSKTALSSV | ||||
| KTSSSQGIIR | NKTLSRSIAS | EVIARPASLS | NDKLMEKSEP | VDQRRHTAGK | ||||
| AIVDSRSAQP | KETSEERKAR | LSEWKAGKGR | VLKRPPNSVV | TQHEPAGQNE | ||||
| KPVGSFWTTM | AEEDEQRLFT | EKVNNTFSEC | LNLINEGCPK | EDILVTLNDL | ||||
| IKNIPDAKKL | VKYWICLALI | EPITSPIENI | IAIYEKAILA | GAQPIEEMRH | ||||
| TIVDILTMKS | QEKANLGENM | EKSCASKEEV | KEVSIEDTGV | DVDPEKLEME | ||||
| SKLHRNLLFQ | DCEKEQDNKT | KDPTHDVKTP | NTETRTSCLI | KYNVSTTPYL | ||||
| QSVKKKVQFD | GTNSAFKELK | FLTPVRRSRR | LQEKTSKLPD | MLKDHYPCVS | ||||
| SLEQLTELGR | ETDAFVCRPN | AALCRVYYEA | DTT |
- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija
[uredi | uredi izvor]Diferencijalnim skriningom difuznih velikih B-ćelijskih limfoma, nakon čega slijedi analiza baze podataka, RT-PCR i skrining ljudskih Jurkat T-ćelijske cDNK biblioteke, Maouche-Chretien et al. (1998) klonirali su CKAP2, koji su nazvali LB1. Transkript sadrži dva konsenzusna signala poliadenilacije i motiv destabilizacije iRNK bogat parom A–U. Izvedeni protein od 683 aminokiseline ima domen bogat leucinom i izoleucinom i brojna potencijalna mjesta fosforilacije. Northern blot analiza otkrila je varijabilnu ekspresiju velikog transkripta od 3,6 do 3,9 kb i manjeg transkripta od 2,2 kb u svim ispitivanim ljudskim tkivima i ćelijskim linijama. Transkripcija/translacija in vitro proizvela je protein s prividnom molekulskom masom od 85 kD, pomoću SDS-PAGE. Imunofluorescentna analiza transficiranih COS ćelikjaa pokazala je da je epitop označen CKAP2 lokaliziran u citoplazmatskim citoskeletnim filamentima.
Diferencijalnim prikazom-PCR primarnih ljudskih adenokarcinoma želuca, nakon čega slijede 5-prim i 3-prim RACE, Bae et al. (2003) klonirali su CKAP2 pune dužine i kraću varijantu, CKAP2S, koja je rezultat alternativne prerade u egzonu 6. CKAP2 protein pune dužine sadrži 682 aminokiseline, a protein CKAP2S 494 aminokiseline. Northern blot analiza pokazala je da je ekspresija CKAP2 veća u mozgu, timusu, bubrezima i posteljici nego u srcu, skeletnim mišićima, plućima, leukocitima i gastrointestinalnom traktu. Drugi, manji transkript otkriven je u tkivima sa visokom ekspresijom CKAP2. Endogeni CKAP2 i CKAP2 označeni fluorescencijom povezani sa centrom za organizaciju mikrotubula i s mikrotubulama u HeLa ćelijama, a ova lokalizacija je izgubljena nakon tretmana sredstvom za destabilizaciju mikrotubula. Western blot analiza otkrila je endogeni CKAP2 pri prividnoj molekulskoj masi od 75 kD.
Funkcija gena
[uredi | uredi izvor]Maouche-Chretien et al (1998) otkrili su da je ekspresija LB1 povećana kod pacijenata sa imunoblastnim podtipom difuznog velikog B-ćelijskog limfoma i kod pacijenata sa multilobiranim centroblastičnim podtipom difuznog velikog B-ćelijskog limfoma. Nasuprot tome, ekspresija je bila niska ili se nije mogla otkriti u črtiri pacijenta s polimorfnim centroblastnim difuznim velikim B-ćelijskim limfomima.
Koristeći testove zaštite ribonukleazama i RT-PCR, Bae et al. (2003) otkrili su da je ekspresija CKAP2 i CKAP2S povećana u tkivima želuca u usporedbi s odgovarajućom normalnom sluznicom. Imunohistohemijska analiza nije otkrila protein CKAP2 u normalnoj sluznici želuca, ali je otkriven u svim pregledanim adenokarcinomima želuca i tubulnim adenomima.[9]
Jeon et al. (2006) otkrili su da CKAP2 nije eksprimiran u fibroblastima ljudskom prepucija koji su zaustavljeni G0/G1-fazi, već da je eksprimiran u ćelijama koje se aktivno dijele, postupno povećavajući između kasnih G1 i G2/M-faza. Razgradnja CKAP2 smanjila je fosforilaciju RB1 i povećalo ekspresiju p27 (CDKN1B), a posljedično je smanjila i proliferaciju ćelija, dok je konstitutivna ekspresija CKAP2 povećala fosforilaciju RB i povećala proliferaciju.[10]
Kompleks/ciklosom koji podstiče anafazu (APC/C) je ubikvitinska ligaza, koja kontrolira odvajanje sestrinske hromatide i izlaz iz mitoze. Prepoznaje dva motiva na svojim podlogama: kutiju za uništavanje (D) i kutiju za KEN. Seki i Fang (2007) otkrili su da je CKAP2 razgrađen pomoću CDH1 i aktiviranog APC/C u ekstraktima Xenopus interfaze, ali ne i u mitotskim ekstraktima. CKAP2 sadrži četiri D-kutije i KEN-kutiju, a analiza mutacije pokazala je da je samo KEN kutija bila potrebna za sveprisutnu primjenu APC/C-CDH1 i razgradnju u međufaznim ekstraktima aktiviranim CDH1. Prekomjerna ekspresija CDH1 u HeLa ćelijama smanjila je nivoe CKAP2 na način ovisan od KEN kutije, dok je oborenje CDH1 povećalo poluvrijeme eliminacije CKAP2. CKAP2 povezan s centrosomskim mikrotubulama u kasnoj G2-fazi u HeLa ćelija, ali tek nakon razdvajanja dupliciranih centrosoma. Tokom mitoze, CKAP2 se povezivao sa polopvima vretena i sa mikrotubulama vretena iz profaze, tokom anafaze i nestao je iz mikrotubula tokom citokineze. Razgradnja CKAP2 nije promijenila distribuciju ćelijskog ciklusa u ćelijama, niti je generiralo mitotske efekte. S druge strane, ektopska ekspresija CKAP2 divljeg tipa ili nerazgradivog CKAP2 mutanta dovela je do mitoskog zaustavljanja s monopolarnim vretenima, koja sadrže visoko usnopljene mikrotubule. Zaključili su da je regulacija CKAP2 pomoću APC/C kritična za normalnu progresiju mitoze.[11]
Reference
[uredi | uredi izvor]- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000136108 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000037725 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Maouche-Chretien L, Deleu N, Badoual C, Fraissignes P, Berger R, Gaulard P, Romeo PH, Leroy-Viard K (Oct 1998). "Identification of a novel cDNA, encoding a cytoskeletal associated protein, differentially expressed in diffuse large B cell lymphomas". Oncogene. 17 (10): 1245–51. doi:10.1038/sj.onc.1202048. PMID 9771967.
- ^ "Entrez Gene: CKAP2 cytoskeleton associated protein 2".
- ^ Maouche-Chretien, L., Deleu, N., Badoual, C., Fraissignes, P., Berger, R., Gaulard, P., Romeo, P. H., Leroy-Viard, K. Identification of a novel cDNA, encoding a cytoskeletal associated protein, differentially expressed in diffuse large B cell lymphomas. Oncogene 17: 1245-1251, 1998. PubMed: 9771967
- ^ "UniProt, Q8WWK9". Pristupljeno 11. 9. 2017.
- ^ Bae, C.-D., Sung, Y.-S., Jeon, S.-M., Suh, Y., Yang, H.-K., Kim, Y. I., Park, K.-H., Choi, J., Ahn, G., Park, J. Up-regulation of cytoskeletal-associated protein 2 in primary human gastric adenocarcinomas. J. Cancer Res. Clin. Oncol. 129: 621-630, 2003. PubMed: 12942315
- ^ Jeon, S.-M., Choi, B., Hong, K. U., Kim, E., Seong, Y.-S., Bae, C.-D., Park, J. A cytoskeleton-associated protein, TMAP/CKAP2, is involved in the proliferation of human foreskin fibroblasts. Biochem. Biophys. Res. Commun. 348: 222-228, 2006. Note: Erratum: Biochem. Biophys. Res. Commun. 354: 839 only, 2007. PubMed: 16876122
- ^ Seki, A., Fang, G. CKAP2 is a spindle-associated protein degraded by APC/C-Cdh1 during mitotic exit. J. Biol. Chem. 282: 15103-15113, 2007. PubMed: 17376772
Dopunska literatura
[uredi | uredi izvor]- Eichmuller S, Usener D, Dummer R, et al. (2001). "Serological detection of cutaneous T-cell lymphoma-associated antigens". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98 (2): 629–34. doi:10.1073/pnas.021386498. PMC 14639. PMID 11149944.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). "Toward a Catalog of Human Genes and Proteins: Sequencing and Analysis of 500 Novel Complete Protein Coding Human cDNAs". Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
- Udina IG, Baranova AV, Kompaniĭtsev AA, Sulimova GE (2001). "[Evolutionarily-conserved gene CKAP2,located in region 13q14.3 of the human genome, is frequently rearranged in various tumors]". Genetika. 37 (1): 120–3. PMID 11234418.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Rakhmanaliev ER, Klimov EA, Kompaniĭtsev AA, Sulimova GE (2003). "[The structure of the human oncogenesis-associated CKAP2 (LB1) gene]". Mol. Biol. (Mosk.). 36 (6): 985–9. PMID 12500535.
- Bae CD, Sung YS, Jeon SM, et al. (2004). "Up-regulation of cytoskeletal-associated protein 2 in primary human gastric adenocarcinomas". J. Cancer Res. Clin. Oncol. 129 (11): 621–30. doi:10.1007/s00432-003-0484-0. PMID 12942315.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
- Dunham A, Matthews LH, Burton J, et al. (2004). "The DNA sequence and analysis of human chromosome 13". Nature. 428 (6982): 522–8. doi:10.1038/nature02379. PMC 2665288. PMID 15057823.
- Jin J, Smith FD, Stark C, et al. (2004). "Proteomic, functional, and domain-based analysis of in vivo 14-3-3 binding proteins involved in cytoskeletal regulation and cellular organization". Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016/j.cub.2004.07.051. PMID 15324660.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, et al. (2006). "Phosphoproteome analysis of the human mitotic spindle". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103 (14): 5391–6. doi:10.1073/pnas.0507066103. PMC 1459365. PMID 16565220.
- Jeon SM, Choi B, Hong KU, et al. (2006). "A cytoskeleton-associated protein, TMAP/CKAP2, is involved in the proliferation of human foreskin fibroblasts". Biochem. Biophys. Res. Commun. 348 (1): 222–8. doi:10.1016/j.bbrc.2006.07.046. PMID 16876122.
- Hong KU, Park YS, Seong YS, et al. (2007). "Functional Importance of the Anaphase-Promoting Complex-Cdh1-Mediated Degradation of TMAP/CKAP2 in Regulation of Spindle Function and Cytokinesis". Mol. Cell. Biol. 27 (10): 3667–81. doi:10.1128/MCB.01386-06. PMC 1900002. PMID 17339342.
- Seki A, Fang G (2007). "CKAP2 is a spindle-associated protein degraded by APC/C-Cdh1 during mitotic exit". J. Biol. Chem. 282 (20): 15103–13. doi:10.1074/jbc.M701688200. PMID 17376772.
Vanjski linkovi
[uredi | uredi izvor]- Lokacija ljudskog genoma CKAP2 i stranica sa detaljima o genu CKAP2 u UCSC Genome Browseru.