Systém súťaže sa oproti predchádzajúcej sezóne z dôvodu zníženia počtu zmenil. Po odohraní základnej časti, ktorá sa hrala štvorkolovo, mala nasledovať vyraďovacia časť. Po rozšírení pandémie koronavírusu sa pôvodne sa mala základná časť nedohrať po 19. kole a malo nasledovať semifinále.[3] Nakoniec bola súťaž 11. marca 2020 predčasne úplne ukončená po nedokončenom 19. kole.[4] Všetky družstvá získali právo nastúpiť do novej sezóny extraligy 2020/21.
↑Čajky majú po sezóne. Extraliga je ukončená, zrušené boli aj finálové turnaje EWBL a CEWL [online]. piestanskecajky.sk, 2020-03-13, [cit. 2020-03-18]. Dostupné online.