Faustovirus

Faustovirus имеет икосаэдрические вирионы размером около 200 нм^[3]. В 2016 году вирионы Faustovirus были детально изучены с помощью криоэлектронной микроскопии. Мажорный белок капсида (англ. major capsid protein, MCP) внешней оболочки этого вируса формирует тримеры^[англ.], каждый мономер которого состоит из двух расположенных друг за другом структурных мотивов jelly roll^[англ.]. Один мотив jelly roll включает 8 бета-листов. Подобная организация мажорного белка капсида встречается у многих вирусов. Капсомер представлен гексамером MCP и достигает около 75 Å в диаметре. В отличие от большинства других гигантских вирусов, у Faustovirus есть и второй, внутренний слой капсида, также образованный белковыми гексамерами^[5].

Геном Faustovirus представлен кольцевой двуцепочечной молекулой ДНК из 466265 пар оснований (п. о.). GC-состав генома равен 36 %. В геноме находятся 451 белок-кодирующих гена, длины их продуктов находятся в промежутке от 47 до 2980 аминокислотных остатков (а. о.). Генов, кодирующих тРНК, в геноме Faustovirus не выявлено. Только для 31 % белков Faustovirus нашлись гомологи в базах данных. Больше всего белков Faustovirus гомологичны белкам Asfarviridae; также имеются белки, родственные белкам вирусов семейств Phycodnaviridae^[англ.], Mimiviridae^[англ.], Marseilleviridae^[англ.] и Ascoviridae^[англ.]. Некоторые белки родственны белкам бактериофагов, кроме того, ряд белков имеют родственников только среди клеточных организмов: эукариот, бактерий и архей. В генах, кодирующих белки капсида, выявлено множество интронов^[5], в числе которых 6 самосплайсирующихся интронов I группы^[англ.] — очень нетипичный для вирусов случай^[3].

Заражение клеток Vermamoeba vermiformis начинается с фагоцитоза протистом вирусных частиц. Через 2—4 часа после инфицирования вирионы выявляются внутри фагосом, некоторые из которых могут находиться даже вблизи клеточного ядра, хотя взаимодействия вирусных частиц с ядром обнаружено не было. Далее фагосомы выпускают своё содержимое в цитоплазму клетки-хозяина: внутренняя мембрана вируса сливается с мембраной фагосомы, и содержимое вириона выходит наружу, подобно тому, как это происходит у мимивируса. После этого часть вирионов перестаёт быть видимыми. Выход белков и ДНК Faustovirus в клетку происходит через 4—6 часов после заражения. Любопытно, что параллельно ядро клетки-хозяина претерпевает некоторую реогранизацию, а именно, оно утрачивает сферическую форму. Через 8—10 часов после инфицирования клетка округляется и теряет связь с субстратом, а в цитоплазме становится отчётливо видна вирусная фабрика, содержащая новообразованные вирусные частицы и окружённая митохондриями. У некоторых клеток в вирусных фабриках находятся только лишь пустые капсиды. Через 12—14 часов после заражения вирусная фабрика занимает уже практически всё свободное пространство в клетке, а через 18—20 часов происходит лизис большинства клеток и выход наружу новых вирионов^[3].

Согласно филогенетическому дереву, построенному на основании последовательности генов семейства^[англ.] ДНК-полимеразы B, Pacmanvirus, Kaumoebavirus, Faustovirus и Asfarviridae формируют монофилетическую кладу. По-видимому, эти вирусы имели общего предка. Последовательность локуса, кодирующего мажорный белок капсида (англ. major capsid protein), сближает Pacmanvirus с Asfarviridae, однако архитектура вириона ближе к таковой у Faustovirus^[6].