第39期王将戦(だい39きおうしょうせん)は、1989年度(1989年1月27日 - 1990年3月30日)の王将戦である。王将戦七番勝負は、米長邦雄九段が南芳一王将に4勝3敗で制し、タイトル奪取。6期ぶり3期目の王将位獲得となった。