百日咳(ひゃくにちぜき / ひゃくにちせき、英: whooping cough, Pertussis)は、主にグラム陰性桿菌の百日咳菌 (Bordetella pertussis) による呼吸器感染症の一種。特有の痙攣性の咳発作を特徴とする急性気道感染症である。 百日咳ワクチンで予防可能な小児疾患であるにも係わらず、発病率が上昇している唯一の疾患である。1歳以下の乳児は重症化しやすく、6カ月以下では死亡の危険性が高い。1990年代以降、先進国での感染者数は増加傾向で、発症者の30%は成人である。