L’aquaculture biologique est la forme de production aquacole qui répond à un cahier des charges imposant certains critères de production dite « biologique ». Il s'agit en quelque sorte de l'équivalent aquacole de l'agriculture biologique. C'est une des réponses se voulant durable à la surpêche, et à une demande sociale croissante de « produits bios ».Une de ses formes les plus sophistiquées pourrait être l' (Integrated Multi-trophic Aquaculture). Article détaillé : Aquaculture.