RNF7

RNF7
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2ECL
Ідентифікатори
Символи	RNF7, CKBBP1, ROC2, SAG, ring finger protein 7, rbx2
Зовнішні ІД	OMIM: 603863 MGI: 1337096 HomoloGene: 84476 GeneCards: RNF7
Пов'язані генетичні захворювання
	гепатит C
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • zinc ion binding; • copper ion binding; • cullin family protein binding; • зв'язування з іоном металу; • NEDD8 transferase activity; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • клітинне ядро; • Cul5-RING ubiquitin ligase complex; • цитоплазма; • гіалоплазма; • Cul2-RING ubiquitin ligase complex; • Cul3-RING ubiquitin ligase complex; • Cul7-RING ubiquitin ligase complex; • nuclear SCF ubiquitin ligase complex; • Cul4-RING E3 ubiquitin ligase complex; • cullin-RING ubiquitin ligase complex;
Біологічний процес	• response to redox state; • Убіквітин-залежний протеоліз; • protein neddylation; • посттрансляційна модифікація; • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9616
	19823
	ENSG00000114125
	ENSMUSG00000051234
	Q9UBF6
	Q9WTZ1
	NM_001201370; NM_014245; NM_183063; NM_183237
	NM_011279; NM_001311135
	NP_001188299; NP_055060; NP_899060
	NP_001298064; NP_035409
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RNF7 (англ. Ring finger protein 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 113 амінокислот, а молекулярна маса — 12 683^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADVEDGEET	CALASHSGSS	GSKSGGDKMF	SLKKWNAVAM	WSWDVECDTC
AICRVQVMDA	CLRCQAENKQ	EDCVVVWGEC	NHSFHNCCMS	LWVKQNNRCP
LCQQDWVVQR	IGK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Ohta T., Michel J.J., Schottelius A.J., Xiong Y. (1999). ROC1, a homolog of APC11, represents a family of cullin partners with an associated ubiquitin ligase activity. Mol. Cell. 3: 535—541. PMID 10230407 doi:10.1016/S1097-2765(00)80482-7
Swaroop M., Gosink M., Sun Y. (2001). SAG/ROC2/Rbx2/Hrt2, a component of SCF E3 ubiquitin ligase: genomic structure, a splicing variant, and two family pseudogenes. DNA Cell Biol. 20: 425—434. PMID 11506706 doi:10.1089/104454901750361488
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Kim Y.-S., Lee J.-Y., Son M.-Y., Park W., Bae Y.-S. (2003). Phosphorylation of threonine 10 on CKBBP1/SAG/ROC2/Rbx2 by protein kinase CKII promotes the degradation of IkappaBalpha and p27Kip1. J. Biol. Chem. 278: 28462—28469. PMID 12748192 doi:10.1074/jbc.M302584200

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з RNF7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10070 (англ.) . Архів оригіналу за 4 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2017-07-04 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9UBF6 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з RNF7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10070 (англ.) . Архів оригіналу за 4 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2017-07-04 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q9UBF6 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]