Eolith, l'entreprise sud coréenne qui s'était occupée de développer The King of Fighters 2001 et 2002, s'associe en 2003 après la faillite de SNK, avec la société M-Dream China pour produire des jeux mobiles[5]. La série est ainsi de nouveau produite au Japon avec The King of Fighters 2003, le jeu marque également le dernier épisode de la série à paraître sur les systèmes Neo-Geo MVS[6] et Neo-Geo AES, la cartouche pèse 716 Mb[7].
Cet épisode fait entrer le système du « Multi Shift » dans la série, où il est possible de changer de personnage en plein combat sans qu'il soit mis KO[8]. Fidèle à la série The King of Fighters, les combats se déroulent par équipe de trois personnages, le gameplay de The King of Fighters 2003 ajoute une nouvelle fonctionnalité qui consiste à désigner un leader[8] qui se verra doter d'une nouvelle technique baptisée « Leader Super Special Move ».
