Пикорнавирусы (лат. Picornaviridae, от pico — маленький и rna — РНК) — семейство, объединяющее маленькие икосаэдрические вирусы высших позвоночных, содержащих одноцепочечную геномную РНК положительной полярности ( то есть соответствующей полярности мРНК). Размер капсида составляет около 20 нм, размер генома - около 7-8 тысяч оснований. Размножение пикорнавирусов происходит в цитоплазме зараженной клетки. К пикорнавирусам относятся возбудители таких важных заболеваний как полиомиелит, ринит, ящур, гепатит А и др.
Строение генома
Геномная РНК пикорнавирусов содержит в большинстве случаев одну открытую рамку считывания под контролем IRES - участка внутренней посадки рибосомы. Трансляция вирусной РНК приводит к образованию гигантского белка-предшественника, который еще до завершения синтеза нарезается вирусными протеазами, с образованием зрелых вирусных белков. К 5' - концу вирусной РНК ковалентно прикреплен маленький белок - VPg (от англ. viral protein genome linked, вирусный белок, соединенный с геномом). 3' - конец полиаденилирован (содержит несколько десятков остатков аденина, подобно клеточным мРНК). На 5' и 3' - концах вирусной РНК располагаются так называемые цис-репликативные элементы (OriL и OriR, соответственно - от англ. origin - начало, Left - левый, Right - правый) - последовательности, необходимые для репликации генома.
Белки пикорнавирусов
Геном пикорнавирусов кодирует около десятка белков обеспечивающих репликацию вирусной РНК, перепрограммирование клетки, сборку зрелых вирионов. Кодирующую область генома довольно условно делят на три участка: P1 - кодирует структурные белки VP1, VP2, VP3, VP4, из которых строится вирусная частица. P2 и P3 - кодируют белки, необходимые для перепрограммирования клетки и репликации:
- 2А - негомологичен у представителей разных родов пикорнавирусов. Например, у афто- и кардиовирусов - это пептид, который вызывает ко-трансляционный разрыв в синтезируемой белковой цепи полипротеина, а у энтеро- и риновирусов - сериновая протеаза.
- 2B и 3A - небольшие гидрофобные белки, принимающие участие в вызываемом пикорнавирусами изменении мембран клетки.
- 2С - этот белок имеет гомологию с хеликазами, входит в состав пикорнавирусного репликативного комплекса.
- 3B - это VPg, белок прикрепляющийся к 5'-концу вирусной РНК.
- 3С - сериновая протеаза, разрезающая полипротеин.
- 3D - РНК-полимераза, белок синтезирующий вирусную РНК.
- L - лидерный белок также негомологичен у представителей разных родов, у ряда пикорнавирусов отсутствует. У афтовтрусов он является протеазой, отщепляющей себя от полипротеина, у кардио- и тешовирусов лишен энзиматической активности.
Ссылки
Semler, B. L., and E. Wimmer. 2002. Molecular Biology of Picornaviruses. American Society for Microbiology, Washington, D.C.