생명 바코드 데이터 시스템
생명 바코드 데이터 시스템(Barcode of Life Data System, 일반적으로 BOLD 또는 BOLDSystems로 알려짐)은 특히 DNA 바코드 전용 웹 플랫폼이다.[1][2] 이 시스템은 캐나다의 생물다양성 유전체학 센터에서 개발한 클라우드 기반 데이터 저장 및 분석 플랫폼으로, 4개의 주요 모듈, 데이터 포털, 교육 포털, BIN(추정 종) 등록, DNA 서열 분석을 위한 온라인 플랫폼을 제공하는 데이터 수집 및 분석 워크벤치로 구성된다.[2] 2005년 출시 이후 BOLD는 데이터 구성, 유효성 검사, 시각화 및 게시를 포함한 다양한 기능을 제공하도록 확장되었다. 2017년에 출시된 시스템의 최신 버전인 버전 4는 데이터 수집 및 분석을 지원하는 일련의 개선 사항을 제공할 뿐만 아니라 데이터 배포, 인용 및 주석을 개선하는 새로운 기능도 포함하고 있다.[3] 2020년 11월 16일 기준으로 BOLD에는 동물, 식물, 균류, 원생생물(약 890만 표본 포함)을 포괄하면서 공식적으로 기술된 318,105종의 바코드 시퀀스가 이미 포함되어 있다.[4]
BOLD는 DNA Barcoding에 관심이 있는 모든 연구자에게 무료로 제공된다. 특화된 서비스를 제공하여, 국제 염기 서열 데이터베이스에서 BARCODE 지정을 얻기 위해 필요한 표준을 충족하는 기록의 출판을 돕는다. 웹 기반 제공 및 유연한 데이터 보안 모델로 인해 광범위한 연구 제휴를 포함하는 프로젝트를 지원하는 데에도 유리한 위치에 있다.[3]
BOLD의 데이터 배포는 주로 2010년부터 2015년까지 iBOL(International Barcode of Life) 컨소시엄에서 실행한 프로젝트 BARCODE 500K[5]에서 비롯되었다. 여기에서는 50만개의 종을 나타내는 5백만개의 표본에 대한 DNA 바코드 레코드의 데이터 수집을 목표로 했다. 모든 표본 수집, 서열 할당, 정보 분류는 전 세계 국가에서 온 수많은 과학자, 협력자 및 시설에 의해 기여되고 있다. 데이터 축적은 DNA 바코드 식별의 정확도를 높이고 생명의 바코드 달성을 용이하게 한다.
각주
[편집]- ↑ Ratnasingham, Sujeevan; Hebert, Paul D. N. (2013). “A DNA-Based Registry for All Animal Species: The Barcode Index Number (BIN) System”. 《PLOS ONE》 8 (7): e66213. Bibcode:2013PLoSO...866213R. doi:10.1371/journal.pone.0066213. ISSN 1932-6203. PMC 3704603. PMID 23861743.
- ↑ 가 나 RATNASINGHAM, SUJEEVAN; HEBERT, PAUL D. N. (2007년 1월 24일). “BARCODING: bold: The Barcode of Life Data System (http://www.barcodinglife.org)”. 《Molecular Ecology Notes》 7 (3): 355–364. doi:10.1111/j.1471-8286.2007.01678.x. ISSN 1471-8278. PMC 1890991. PMID 18784790.
- ↑ 가 나 “BOLD Print Handbook for BOLD v4”. 《www.boldsystems.org》. 2020년 11월 16일에 확인함.
- ↑ “Kingdoms of Life Being Barcoded | BOLDSYSTEMS”. 《www.boldsystems.org》. 2020년 11월 16일에 확인함.
- ↑ “BARCODE 500K”. 《ibol.org》. 2021년 8월 16일에 원본 문서에서 보존된 문서. 2023년 2월 22일에 확인함.
외부 링크
[편집]- 생명 바코드 데이터 시스템 - 공식 웹사이트