Το Πρωτάθλημα της ΕΠΣ Αθηνών την περίοδο 1967-68 διεξήχθη σε τρεις κατηγορίες με δύο ομίλους η κάθε μία. Πρωταθλητής αναδείχθηκε ο νικητής του Β΄ ομίλου Ποσειδών Γλυφάδας, που επικράτησε με 2-1 στον αγώνα κατάταξης επί του νικητή του Α΄ όμιλου Ίκαρου, ο οποίος είχε δημιουργηθεί μόλις το προηγούμενο καλοκαίρι από αναγκαστική συγχώνευση των ιστορικών ομάδων Π.Α.Ο. Καλογρέζας και ΠΑΟ Σαφράμπολη. Όμως, στο ειδικό πρωτάθλημα για την άνοδο στη Β΄ εθνική επικράτησε ο Ίκαρος που ανέβηκε κατηγορία ενώ ο Ποσειδών απέτυχε. Η σεζόν αυτή ήταν η πρώτη από την επικράτηση του δικτατορικού καθεστώτος της 21ης Απριλίου 1967, οι αρχές της οποίας επέβαλαν πλήθος συγχωνεύσεων και μετονομασιών ομάδων καθώς και αναδιάρθρωση των κατηγοριών. Από τη σεζόν αυτή καθιερώνεται πρωτάθλημα τριών κατηγοριών με ομίλους σε κάθε κατηγορία, ένα σύστημα που υπάρχει μέχρι σήμερα.
Κατά το χρονικό διάστημα 1966-1968 είχαμε τη δημιουργία πολλών νέων ομάδων που προήλθαν από συγχωνεύσεις παλαιότερων είτε ηθελημένες είτε εξαναγκαστικές. Κάποιοι σύλλογοι ιδρύθηκαν ξανά μετά τη δικτατορία. Επίσης, πολλοί σύλλογοι εξαναγκάστηκαν σε αδράνεια από το δικτατορικό καθεστώς. Μερικοί επανιδρύθηκαν μετά τη δικτατορία, όπως:
Α.Ε. Γαλατσίου: ίδρυση 1938, διάλυση 1967, επανίδρυση 1974. Εν τω μεταξύ το 1969 είχε ιδρυθεί ο "Α.Ο. Γαλατσίου". Το 2004 οι δύο σύλλογοι συγχωνεύτηκαν στον ενιαίο σύλλογο: Π.Α.Σ. Γαλάτσι.
Αετός Καισαριανής: Α.Ε. Καισαριανής (από το 1926 ανεπίσημος, ως Γ.Σ.), Πανιώνιος Καισαριανής (1946, επανιδρύθηκε το 1980). Είναι ο σημερινός Γ.Σ. Καισαριανής.
Αιολικός Καισαριανής: Απόλλων Καισ. και Φωστήρ Καισαριανής (1946, επανιδρύθηκε μετά τη δικτατορία ως «Π.Α.Ο. Φωστήρας Κ.»).
Ακάδημος Κολωνού: Α.Ο. Πεζοπορικός (από 1961 στην ΕΠΣΑ ως «Φιλικός», από 1964 ως «Πεζοπορικός»), Α.Ο. Ορφεύς Αθηνών (από 1959 στην ΕΠΣΑ). Από το 2006 έχει γίνει «Α.Ο. Ακάδημος Αμαρουσίου».
Αρίων Παγκρατίου: Σ.Φ.Α. Αρίων Αγ. Αρτεμίου (1928, επανίδρυση 1974 ως «Γ.Σ. Αρίων Αγ. Αρτεμίου»), Άρης Παγκρατίου (επανιδρύθηκε το 1975).
Βυζάντιο: Πέρα Κλουμπ (1918 Κωνσταντινούπολη, 1924 Αθήνα, επανιδρύθηκε μετά τη δικτατορία), Φειδιππίδης.
Γ.Σ. Βύρωνα: Αστόρια Ζ. Πηγής (1954), Φοίβος Βύρωνα. Μετά τη δικτατορία μετονομάστηκε σε "Α.Ο. Βύρων".
Γρανικός Α.Ο.: Α.Ο. Θερμοπυλών, Α.Ο. Κεραμεικός (πρώην Εθνικός Κολωνού από το 1927 τουλάχιστον, από το 1930 Κεραμεικός - υπήρχε και Α.Φ.Ο. Κεραμεικός).
Ζευς Αμπελοκήπων: Κρόνος Αθηνών (1924, επανιδρύθηκε μετά τη δικτατορία ως ΑΠΟ Κρόνος), Μεσογειακός Αστήρ.
Θεμιστοκλής Αιγάλεω: Π.Α.Ο. Ζέφυρος (1953, επανιδρύθηκε το 1984 ως «Α.Ο. Ζέφυρος Αιγάλεω», μετονομάστηκε το 2008 σε «Α.Ε. Αιγάλεω City»), Γ.Α.Σ. Άρτεμις Αιγάλεω. Το 2009 ο Θεμιστοκλής απορροφήθηκε από τον ΠΑΟΚ Γλυφάδας. Το 2014, ωστόσο, η ομάδα δραστηριοποιήθηκε εκ νέου, αποκτώντας το καταστατικό του Απόλλωνα Αθηνών 2006 που διαλύθηκε.
Α.Ε. Κηπούπολις: Α.Ε. Περιστερίου (με το ίδιο όνομα ιδρύθηκε σύλλογος το 2006 από συγχώνευση Φλόγας και Αναγέννησης Περιστερίου), Π.Α.Ο. Κηπουπόλεως (1961).
Α.Ο. Κολωνού: Νίκη Κολωνού (1947), Νέα Ελλάς Κολωνού.
Π.Α.Σ. Παλαιό Φάληρο: Σαρωνικός Π. Φαλήρου (1964), Δάφνη Π. Φαλήρου (1946, επανιδρύθηκε το 1971 ως «Δάφνη Εκάλης» και το 1974 μετακόμισε ξανά στο Π. Φάληρο ως «Α.Ο. Δάφνη Π. Φαλήρου-Αγ. Βαρβάρας»), Τρίτων Π. Φαλήρου και Π.Α.Ο. Αμφιθέας (1954).
Περικλής Περιστερίου: Άμυνα Περ., Φλόγα (επανιδρύθηκε μετά τη δικτατορία, το 2006 συγχωνεύτηκε με την Αναγέννηση στην ΑΕ Περιστερίου) και Πράσινα Πουλιά (1931, επανιδρύθηκε μετά τη δικτατορία ως "ΠΑΟ Πράσινα Πουλιά").
Α.Ο. Περιστερίου: Θύελλα Περιστερίου (πριν το 1940, επανιδρύθηκε το 1983), Εθνικός Περιστερίου, ΑΕ Ταξιαρχών (πριν το 1940).
Υποβιβασμός: προβλεπόταν υποβιβασμός δύο ομάδων (Α.Ο. Κηφισιάς, Χαραυγιακός). Τελικά, δεν χρειάστηκε, διότι αφ' ενός δεν υποβιβάστηκε καμιά αθηναϊκή ομάδα από τη Β΄ Εθνική, αφ' ετέρου "άδειασε" άλλη μια θέση μετά τη συγχώνευση της Ολυμπιάδας με την Ιεράπολη.
1 Για να κριθεί ποια ομάδα θα τερματίσει τελευταία στην κατηγορία (και ενδεχομένως να υποβιβαστεί) έγιναν αρχικά αγώνες κατάταξης των ισόβαθμων στη 12η θέση στο Β΄ όμιλο: Χαραυγιακός - Αττικός: 3-2, Αττικός - Ολυμπιάς: 4-1 και Ολυμπιάς - Χαραυγιακός: 3-1. Στην ειδική βαθμολογία: 1) Αττικός 5β. (6-4), 2) Ολυμπιάς Αιγάλεω 5β. (4-5), 3) Χαραυγιακός 5 β. (4-5) [διότι είχε ηττηθεί από την Ολυμπιάδα]. Ακολούθησε ο αγώνας κατάταξης: Χαραυγιακός - Α.Ο. Κηφισιάς: 1-0. Τελικά, δεν υποβιβάστηκε καμία ομάδα.
Μετείχαν 38 ομάδες, χωρισμένες σε δύο ομίλους των 19, με την ακόλουθη προέλευση (σε παρένθεση οι ομάδες που συγχωνεύτηκαν για τη δημιουργία νέων συλλόγων):
↑Προπολεμικά υπήρχε ο Α.Ο. Πατησίων, ο οποίος ιδρύθηκε ως ανεπίσημος ποδοσφαιρικός σύλλογος το Δεκέμβριο του 1924 με το όνομα «Κέρβερος Πατησίων». Σταδιακά απορρόφησε τις ανεπίσημες ομάδες της συνοικίας Σύνδεσμος Πατησίων, Αδιάλυτος και Αστήρ και το 1928 έγινε επίσημο σωματείο ως «Α.Ο. Πατησίων». Το 1929 εντάχθηκε στην Γ΄ ΕΠΣΑ και αμέσως ανέβηκε στη Β΄, όπου έπαιξε ως το 1934, οπότε υποβιβάστηκε. Δεν είναι γνωστή η τύχη του στη συνέχεια, βλ."Τα 10 χρόνια του ΑΟ Πατησίων", εφ. "Αθλητικός Χρόνος", 7/1/1935, ψηφ. σελ. 228.Αρχειοθετήθηκε 2015-09-28 στο Wayback Machine.