File:Binding of anti-cancer drug gemcitabine-squalene to human serum albumin.png

From Wikimedia Commons, the free media repository
Jump to navigation Jump to search

Original file (4,302 × 4,002 pixels, file size: 10 MB, MIME type: image/png)

Captions

Captions

Binding of anti-cancer drug gemcitabine-squalene to human serum albumin

Summary

[edit]
Description
English: Gemcitabine-squalene is a prospective anti-cancer drug, which interacts with serum albumin in the blood by means of unspecific hydrophobic and Van der Waals interactions. The picture shows possible binding sites of gemcitabine-squalene on the surface of human serum albumin found by molecular docking simulations [1]. All energetically favorable positions of the ligand on the surface of the protein, which were revealed by docking, are superimposed in the picture to visualize the broad range of binding location. Different molecular representations of the ligands and protein are used in different panel:
  1. Protein: cartoon representation, ligands: balls and sticks.
  2. Protein: cartoon representation, ligands: space fill.
  3. Protein and ligands: coarse-grained molecular surfaces.
  4. Protein: solvent-accessible surface, ligands: sticks.
  5. Protein: tube colored by secondary structure, ligands: space fill.
  6. Protein and ligands: balls and sticks.
  7. Protein: coarse-grained molecular surface colored by residue, ligands: balls and sticks.
  8. Protein: high-density isovalue of trajectory-averaged density map, ligands: sticks.
  9. Protein and ligands: sticks surrounded by semi-transparent molecular surface.
Українська: Гемцитабін-сквален - це перспективний протираковий препарат, який взаємодіє з сироватковим альбуміном крові за рахунок гідрофобних та Ван дер Ваальсових взаємодій. Рисунок показує можливі сайти зв'язування гемцитабін-сквалену на поверхні сироваткового альбуміну людини виявлені методом молекулярного докінгу [1]. Показано всі енергетично вигідні положення ліганду на поверхні білку, які було отримано в результаті докінгу, щоб продемонструвати широкий спектр можливих місць зв'язування. На різних панелях малюнку показано різні молекулярні представлення молекул ліганду та самого білку:
  1. Білок: схема вторинної структури, ліганди: кульки та палочки.
  2. Білок: схема вторинної структури, ліганди: просторово заповнене предствалення.
  3. Білок та ліганди: грубозерниста молекулярна поверхня.
  4. Білок: поверхня доступна для розчинника, ліганди: палочки.
  5. Білок: трубка з кольорами відповідно до вторинної структури, ліганди: просторово заповнене предствалення.
  6. Білок та ліганди: кульки та палочки.
  7. Білок грубозерниста молекулярна поверхня з кольорами по залишкам, ліганди: кульки та палочки.
  8. Білок: Ізоповерхня карти густини усередненої по траєкторії, ліганди: палочки.
  9. Білок та ліганди: палочки оточені напівпрозорою молекулярною поверхнею.
English: Binding of anti-cancer drug gemcitabine-squalene to human serum albumin
Date
Source Own work
Author Yesint

Licensing

[edit]
I, the copyright holder of this work, hereby publish it under the following license:
w:en:Creative Commons
attribution
This file is licensed under the Creative Commons Attribution 4.0 International license.
You are free:
  • to share – to copy, distribute and transmit the work
  • to remix – to adapt the work
Under the following conditions:
  • attribution – You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use.


  1. ↑ a b Semen O. Yesylevskyy, Christophe Ramseyer, Mariia Savenko, Simona Mura, Patrick Couvreur, Low-Density Lipoproteins and Human Serum Albumin as Carriers of Squalenoylated Drugs: Insights from Molecular Simulations, Mol. Pharmaceutics 2018, 15, 2, 585-591, https://doi.org/10.1021/acs.molpharmaceut.7b00952

File history

Click on a date/time to view the file as it appeared at that time.

Date/TimeThumbnailDimensionsUserComment
current14:22, 26 November 2019Thumbnail for version as of 14:22, 26 November 20194,302 × 4,002 (10 MB)Yesint (talk | contribs)User created page with UploadWizard

You cannot overwrite this file.

File usage on other wikis

Retrieved from "https://commons.wikimedia.org/w/index.php?title=File:Binding_of_anti-cancer_drug_gemcitabine-squalene_to_human_serum_albumin.png&oldid=824335285"