Izvorni kôd stranice Ljudski mikrobiom

Nemate dopuštenje da uredite ovu stranicu, iz sljedećeg razloga:

Your IP address is in a range that has been blocked on all Wikimedia Foundation wikis.

The block was made by ‪EPIC‬. The reason given is Open proxy/Webhost: See the help page if you are affected.

Start of block: 09:48, 2 juli 2024
Expiry of block: 09:48, 2 juli 2025

Your current IP address is 206.189.44.186. The blocked range is 206.189.32.0/20.

Navedite sve gornje podatke u upite ili zahtjeve za deblokadu. Ako smatrate da ste greškom blokirani, dodatne informacije i uputstva možete pronaći na stranici o globalnoj smjernici "Zabranjeni otvoreni proksiji".

U suprotnom, zahtjev za blokadu postavite na Meta-Wikiju. You could also send an email to the stewards VRT queue at stewards@wikimedia.org including all above details.

Možete vidjeti i kopirati izvorni kôd ove stranice.

{{Distinguish|Mikrobiom}}
[[Slika:Skin_Microbiome20169-300.jpg|upright=1.25|thumb| Grafikon koji prikazuje ljudsku [[kožna mikrobiota|mikrobiotu kože]], s relativnom zastupljenošću različitih klasa bakterija]]
'''Ljudski mikrobiom''' je skup svih [[mikrobiota]] koji se nalaze na ili unutar ljudskih [[tkivo|tkiva]] i [[tjelesna tečnost|biofluida]], zajedno s odgovarajućim anatomskim mjestima u kojima se nalaze,<ref name="pmid26229597 "/> uključujući [[koža|kožu]], [[mliječne žlijezde]], [[sjeme]]nu tekućinu, [[materica|maternicu]], [[jajnički folikul|jajničke folikule]], [[pluća]], [[pljuvačka|pljuvačku]], [[oralnu sluznicu]], [[konjunktiva|konjuktivu]], [[bilijarni trakt]] i ljudski [[gastrointestinalni trakt]]. Tipovi [[Lista ljudske mikrobiote|ljudske mikrobiote]] uključuju [[bakterije]], [[archaea]], [[gljive]], [[protisti|protiste]] i [[virusi|viruse]]. Iako [[mikroživotinje]] mogu živjeti i na ljudskom tijelu, one su obično isključene iz ove definicije. U kontekstu [[genomika|genomike]], termin ''ljudski mikrobiom'' se ponekad koristi za označavanje kolektiva [[genom]]a rezidentnih mikroorganizama;<ref name="Prescotts">{{Cite book | vauthors = Sherwood L, Willey J, Woolverton C |url={{google books|plainurl=y|id=sBCSRAAACAAJ}} |title=Prescott's Microbiology |publisher=McGraw Hill |year=2013 |isbn=9780073402406 |edition=9th |location=New York |pages=713–721 |oclc=886600661 |name-list-style=vanc}}</ref> međutim, termin ''[[metagenom|ljudski metagenom]]'' ima isto značenje.<ref name="pmid26229597">{{cite journal | vauthors = Marchesi JR, Ravel J | title = The vocabulary of microbiome research: a proposal | journal = Microbiome | volume = 3 | pages = 31 | date = 2015 | pmid = 26229597 | pmc = 4520061 | doi = 10.1186/s40168-015-0094-5 | quote = <br />Microbiome<br />This term refers to the entire habitat, including the microorganisms (bacteria, archaea, lower and higher eurkaryotes, and viruses), their genomes (i.e., genes), and the surrounding environmental conditions. This definition is based on that of "biome," the biotic and abiotic factors of given environments. Others in the field limit the definition of microbiome to the collection of genes and genomes of members of a microbiota. It is argued that this is the definition of [[Metagenomics|metagenome]], which combined with the environment constitutes the microbiome. }}</ref>
 
Ljudi su kolonizirani mnogim [[mikroorganizmi]]ma, sa približno istim [[red veličine|redom veličine]] neljudskih ćelija kao i ljudske ćelije.<ref name="Sender">{{Cite journal |vauthors=Sender R, Fuchs S, Milo R |date=januar 2016 |title=Are We Really Vastly Outnumbered? Revisiting the Ratio of Bacterial to Host Cells in Humans |journal=Cell |volume=164 |issue=3 |pages=337–40 |doi=10.1016/j.cell.2016.01.013 |pmid=26824647 |doi-access=free}}</ref> Neki mikroorganizmi koji koloniziraju ljude su [[komensalizam|komensali]], što znači da koegzistiraju bez štete po ljude; drugi imaju [[Mutualizam (biologija)|mutualistički]] odnos sa svojim ljudskim domaćinima<ref name="Prescotts" />{{rp|700}}<ref name="Quigley2013rev">{{Cite journal |vauthors=Quigley EM |date=septembar 2013 |title=Gut bacteria in health and disease |journal=Gastroenterology & Hepatology |volume=9 |issue=9 |pages=560–9 |pmc=3983973 |pmid=24729765}}</ref> Suprotno tome, neki ne[[patogen]]i mikroorganizmi mogu oštetiti ljudske domaćine putem [[metabolit]]a koje proizvode, poput [[trimetilamin]]a, koji ljudsko tijelo pretvara u [[trimetilamin N-oksid]], putem [[FMO3]]-posredovane oksidacije.<ref name="TMA">{{Cite journal |vauthors=Falony G, Vieira-Silva S, Raes J |date=2015 |title=Microbiology Meets Big Data: The Case of Gut Microbiota-Derived Trimethylamine |url=https://archive.org/details/sim_annual-review-of-microbiology_2015_69/page/305 |journal=Annual Review of Microbiology |volume=69 |pages=305–21 |doi=10.1146/annurev-micro-091014-104422 |pmid=26274026 |quote=we review literature on trimethylamine (TMA), a microbiota-generated metabolite linked to atherosclerosis development.}}</ref><ref name="TMA diseases">{{Cite journal |vauthors=Gaci N, Borrel G, Tottey W, O'Toole PW, Brugère JF |date=novembar 2014 |title=Archaea and the human gut: new beginning of an old story |journal=World Journal of Gastroenterology |volume=20 |issue=43 |pages=16062–78 |doi=10.3748/wjg.v20.i43.16062 |pmc=4239492 |pmid=25473158 |quote=Trimethylamine is exclusively a microbiota-derived product of nutrients (lecithin, choline, TMAO, L-carnitine) from normal diet, from which seems originate two diseases, trimethylaminuria (or Fish-Odor Syndrome) and cardiovascular disease through the proatherogenic property of its oxidized liver-derived form.}}</ref> Određeni mikroorganizmi obavljaju zadatke za koje se zna da su korisni ljudskom domaćinu, ali uloga većine njih nije dobro shvaćena. Oni za koje se očekuje da budu prisutni i koji u normalnim okolnostima ne uzrokuju bolest, ponekad se smatraju "normalnom florom" ili "normalnom mikrobiotom".<ref name="Prescotts"/>
 
[[Projekt ljudsog mikrobioma]] (HMP) je preuzeo projekt sekvenciranja [[genom]]a ljudske mikrobiote, fokusirajući se posebno na mikrobiotu koja normalno nastanjuje [[koža|kožu]], [[usta]], [[nos]], [[probavni trakt]] i [[vagina|vaginu]].<ref name=" Prescotts"/> Dostigla je prekretnicu 2012. godine kada je objavila svoje početne rezultate.<ref name="hmpdata">{{Cite web |url=http://www.nih.gov/news/health/jun2012/nhgri-13.htm |title=NIH Human Microbiome Project defines normal bacterial makeup of the body |date=13. 6. 2012 |publisher=NIH News}}</ref>
 
==Terminologija==
{{vremenska linija života}}
Iako je naširoko poznat kao ''flora'' ili ''mikroflora'', ovo je [[pogrešan naziv]] u tehničkom smislu, budući da se korijen riječi ''[[flora]]'' odnosi na biljke, a ''[[Biota (ekologija)|biota]]'' se odnosi na ukupnu kolekciju organizama u određenom [[ekosistem]]u. Nedavno se primjenjuje prikladniji izraz ''[[mikrobiota]]'', iako njegova upotreba nije zasjenila uvriježenu upotrebu i prepoznavanje ''flore'' u odnosu na bakterije i druge mikroorganizme. Oba termina se koriste u različitoj literaturi.<ref name=Quigley2013rev/>

==Relativni brojevi==
Od 2014. u popularnim medijima i naučnoj literaturi objavljeno je da u ljudskom tijelu ima oko 10 puta više mikrobnih ćelija nego ljudskih ćelija; ova brojka je zasnovana na procjenama da ljudski mikrobiom uključuje oko 100 triliona bakterijskih ćelija i da odrasli čovjek obično ima oko 10 triliona sopstvenuh ćelija.<ref name="AAM2014">American Academy of Microbiology [http://academy.asm.org/index.php/faq-series/5122-humanmicrobiome FAQ: Human Microbiome] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20161231092333/http://academy.asm.org/index.php/faq-series/5122-humanmicrobiome |date=31. 12. 2016 }} January 2014</ref> U 2014., [[Američka akademija za mikrobiologiju]] objavila je [[FAQ]] u kojem se naglašava da su i broj mikrobnih ćelija i broj ljudskih ćelija procene, i napominje da je nedavno istraživanje došlo do nove procjene broja ljudskih ćelija{{ndash}}približno 37,2 triliona, što znači da je odnos mikrobnih i ljudskih ćelija, ako je tačna prvobitna procjena od 100 triliona bakterijskih ćelija, bliži 3:1.<ref name=AAM2014/><ref name="Rosner">{{Cite journal|last=Rosner|first=Judah L.|date=1. 2. 2014|title=Ten Times More Microbial Cells than Body Cells in Humans?|url=http://www.asmscience.org/content/journal/microbe/10.1128/microbe.9.47.2|journal=Microbe Magazine|language=en|volume=9|issue=2|pages=47|doi=10.1128/microbe.9.47.2|issn=1558-7452}}</ref> U 2016., druga grupa objavila je novu procjenu omjera koji je otprilike 1:1 (1,3:1, sa "neizvjesnošću od 25% i varijacijom od 53% u odnosu na populaciju od standardnih 70 kg kod muškaraca").<ref name=Sender/><ref name="NN2016">{{Cite journal|last=Abbott|first=Alison|date=8. 1. 2016|title=Scientists bust myth that our bodies have more bacteria than human cells|url=https://www.nature.com/articles/nature.2016.19136|journal=Nature|language=en|doi=10.1038/nature.2016.19136|s2cid=190879263 |issn=1476-4687|doi-access=free}}</ref>
 
Novija procjena je omjer bakterijskih ćelija od 1,3:1 za svaku ljudsku ćeliju, dok broj faga i virusa premašuje bakterijske ćelije barem za red veličine više. Broj bakterijskih gena (pod pretpostavkom da je u crijevima 1.000 vrsta bakterija sa 2.000 gena po vrsti) procjenjuje se na 2,000.000 gena, 100 puta više od otprilike 20.000 ljudskih gena.<ref>{{cite journal | vauthors = Gilbert JA, Blaser MJ, Caporaso JG, Jansson JK, Lynch SV, Knight R | title = Current understanding of the human microbiome | journal = Nature Medicine | volume = 24 | issue = 4 | pages = 392–400 | date = april 2018 | pmid = 29634682 | pmc = 7043356 | doi = 10.1038/nm.4517 }}</ref>
 
== Tipovi ==
=== Bakterije ===
[[slika:Commensals vs pathogens mechanism.png|thumb|upright=1.25| Mehanizam komensala protiv patogena. Mehanizmi koji leže u osnovi upale kod KOPB-a. [[Epitel]] dišnih puteva ima složenu strukturu: sastoji se od najmanje sedam različitih tipova ćelija koje međusobno komuniciraju putem čvrstih spojeva. Štaviše, epitelni pozivi mogu dostaviti signale u osnovna tkiva koja učestvuju u mehanizmima urođene i adaptivne imunske odbrane. Ključni prenosioci signala su [[dendritske ćelije]]. Jednom kada patogena bakterija (npr. ''S. pneumoniae'', ''P. aeruginosa'') aktivira određene receptore za prepoznavanje uzoraka na/u epitelnim ćelijama, aktiviraju se proupalni signalni putevi. To rezultira uglavnom proizvodnjom IL-1, IL-6 i IL-8. Ovi [[citokin]]i induciraju [[hemotaksija|hemotaksiju]] do mjesta infekcije u njenim ciljnim ćelijama (npr. [[neutrofili]], [[dendritske ćelije]] i [[makrofag]]i). S druge strane, predstavnici standardne mikrobiote izazivaju samo slabu signalizaciju koja sprečava upalu. Mehanizam razlikovanja bezopasnih i štetnih bakterija na molekulskom, kao i na fiziološkom nivou nije u potpunosti shvaćen.]]
 
Populacije mikroba (kao što su [[bakterije]] i [[kvasci]]) naseljavaju kožu i mukozne površine u različitim dijelovima tijela. Njihova uloga je dio normalne, zdrave ljudske fiziologije, međutim ako broj mikroba raste izvan uobičajenog raspona (često zbog kompromitovanog [[imunolološki sistem|imunskog sistema]]) ili ako se mikrobi nastanjuju (kao što je loša higijena ili ozljeda) područja tijela koja obično nisu kolonizirana ili sterilna (kao što je [[krv]], ili donji [[respiratorni trakt]], ili [[trbušna šupljina]]), može doći do bolesti (uzrokujući, respektivno, bakteriemiju/[[sepsa|sepsu]], [[upala pluća|upalu pluća]] i peritonitis).
 
[[Projekt ljudskog mikrobioma]] otkrio je da pojedinci ugošćuju hiljade tipova bakterija, a različita mjesta u tijelu imaju svoje posebne zajednice. [[Koža]] i [[vagina|vaginska]] mjesta pokazala su manju raznolikost od [[usta]] i [[crijeva]], te su pokazala najveće bogatstvo. Bakterijski sastav za dato mjesto na tijelu varira od osobe do osobe, ne samo po vrsti, već i po obilju. Bakterije iste vrste koje se nalaze u ustima su višestrukih podtipova, preferirajući da naseljavaju izrazito različite lokacije u ustima. Čak i enterotipovi u ljudskom crijevu, za koje se ranije mislilo da su dobro shvaćeni, potiču iz širokog spektra zajednica sa zamagljenim granicama [[takson]]a.<ref>[http://www.plos.org/media/press/2012/PLoS_%20HMP_Collection_Manuscript_Summaries.pdf PLoS Human Microbiome Project Collection Manuscript Summaries] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20140304161937/http://www.plos.org/media/press/2012/PLoS_%20HMP_Collection_Manuscript_Summaries.pdf |date=4. 3. 2014 }} 13 June 2012</ref><ref>{{cite web|url = http://www.ucsf.edu/news/2012/06/12149/consortium-scientists-map-human-bodys-bacterial-ecosystem|title = Consortium of Scientists Map the Human Body's Bacterial Ecosystem|work = ucsf.edu}}</ref>
 
Procjenjuje se da 500 do 1.000 [[vrsta]] bakterija živi u ljudskim crijevima, ali pripadaju samo nekoliko tipova: [[Bacillota]] i [[Bacteroidota]] dominiraju, ali postoje i [[Pseudomonadota]], [[Verrucomicrobiota]], [[Actinobacteriota]], [[Fusobacteriota]] i "[[Cyanobacteria]]".<ref name=Sommer2013rev>{{cite journal | vauthors = Sommer F, Bäckhed F | title = The gut microbiota--masters of host development and physiology | journal = Nature Reviews. Microbiology | volume = 11 | issue = 4 | pages = 227–38 | date = april 2013 | pmid = 23435359 | doi = 10.1038/nrmicro2974 | s2cid = 22798964 }}</ref>
 
Brojne vrste bakterija, kao što su ''[[Actinomyces viscosus]]'' i ''[[Actinomyces naeslundii|A. naeslundii]]'', žive u ustima, gde su dio ljepljive supstance zvane [[Zubni plak|plak]]. Ako se ovo ne ukloni četkanjem, stvrdne se u [[zubni kamenac]] (koji se naziva i kamenac). Iste bakterije također luče kiseline koje rastvaraju [[caklina|zubnu caklinu]], uzrokujući [[karijes]].
 
[[Vaginska mikrobiota]] se uglavnom sastoji od raznih vrsta roda ''[[Lactobacillus]]''. Dugo se smatralo da je najčešća od ovih vrsta ''[[Lactobacillus acidophilus]]'', ali se kasnije pokazalo da je ''[[Lactobacillus iners|L. iners]]'' je zapravo najčešći, a slijedi ''[[Lactobacillus crispatus|L. crispatus]]''. Ostali laktobacili koji se nalaze u vagini su ''[[Lactobacilus jensenii]], [[Lactobacillus delbruekii|L. delbruekii]]'' i ''[[Lactobacillus gasseri|L. gasseri]]''. Poremećaj vaginske flore može dovesti do [[infekcija]] kao što su [[bakterijska vaginoza]] ili [[kandidijaza]] ("gljivična infekcija")
 
=== Archaea ===
[[Archaea]] prisutne su u ljudskom crijevu, ali, za razliku od ogromne raznolikosti [[bakterija]] u ovom organu, broj arhejskih vrsta je mnogo ograničeniji.<ref>{{cite journal | vauthors = Eckburg PB, Bik EM, Bernstein CN, Purdom E, Dethlefsen L, Sargent M, Gill SR, Nelson KE, Relman DA | display-authors = 6 | title = Diversity of the human intestinal microbial flora | journal = Science | volume = 308 | issue = 5728 | pages = 1635–8 | date = juni 2005 | pmid = 15831718 | pmc = 1395357 | doi = 10.1126/science.1110591 | bibcode = 2005Sci...308.1635E }}</ref> Dominantna grupa su [[metanogen]], posebno ''[[Methanobrevibacter smithii]]'' i ''[[Methanosphaera|Methanosphaera stadtmanae]]''.<ref>{{cite journal | vauthors = Duncan SH, Louis P, Flint HJ | title = Cultivable bacterial diversity from the human colon | journal = Letters in Applied Microbiology | volume = 44 | issue = 4 | pages = 343–50 | date = april 2007 | pmid = 17397470 | doi = 10.1111/j.1472-765X.2007.02129.x | s2cid = 43706882 | doi-access = free }}</ref> Međutim, kolonizacija metanogenima je promjenjiva i samo oko 50% ljudi ima lahko uočljive populacije ovih organizama.<ref>{{cite journal | vauthors = Florin TH, Zhu G, Kirk KM, Martin NG | title = Shared and unique environmental factors determine the ecology of methanogens in humans and rats | url = https://archive.org/details/sim_american-journal-of-gastroenterology_2000-10_95_10/page/2872 | journal = The American Journal of Gastroenterology | volume = 95 | issue = 10 | pages = 2872–9 | date = oktobar 2000 | doi = 10.1111/j.1572-0241.2000.02319.x | pmid = 11051362 | citeseerx = 10.1.1.606.4187 | s2cid = 1087298 }}</ref>
 
Od 2007. godine nisu poznati jasni primjeri arhejskih [[patogen]]a,<ref>{{cite journal | vauthors = Eckburg PB, Lepp PW, Relman DA | title = Archaea and their potential role in human disease | journal = Infection and Immunity | volume = 71 | issue = 2 | pages = 591–6 | date = februar 2003 | pmid = 12540534 | pmc = 145348 | doi = 10.1128/IAI.71.2.591-596.2003 }}</ref><ref>{{cite journal | vauthors = Cavicchioli R, Curmi PM, Saunders N, Thomas T | title = Pathogenic archaea: do they exist? | journal = BioEssays | volume = 25 | issue = 11 | pages = 1119–28 | date = novembar 2003 | pmid = 14579252 | doi = 10.1002/bies.10354 }}</ref> iako je predložena veza između prisustva nekih metanogena i ljudi kao [[parodontoza|parodontna bolest]].<ref>{{cite journal | vauthors = Lepp PW, Brinig MM, Ouverney CC, Palm K, Armitage GC, Relman DA | title = Methanogenic Archaea and human periodontal disease | journal = Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America | volume = 101 | issue = 16 | pages = 6176–81 | date = april 2004 | pmid = 15067114 | pmc = 395942 | doi = 10.1073/pnas.0308766101 | bibcode = 2004PNAS..101.6176L | doi-access = free }}</ref>
 
=== Gljive ===
{{također pogledajte|Mikobiota (ljudi)}}
Gljive, posebno [[kvasci]], prisutne su u ljudskim crijevima.<ref name="mycobiome">{{cite journal | vauthors = Cui L, Morris A, Ghedin E | title = The human mycobiome in health and disease | journal = Genome Medicine | volume = 5 | issue = 7 | pages = 63 | date = juli 2013 | pmid = 23899327 | pmc = 3978422 | doi = 10.1186/gm467 }} [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3978422/figure/F2/ Figure 2: Distribution of fungal genera in different body sites]</ref><ref name=Martins2014Candidiasis>{{cite journal | vauthors = Martins N, Ferreira IC, Barros L, Silva S, Henriques M | title = Candidiasis: predisposing factors, prevention, diagnosis and alternative treatment | journal = Mycopathologia | volume = 177 | issue = 5–6 | pages = 223–40 | date = juni 2014 | pmid = 24789109 | doi = 10.1007/s11046-014-9749-1 | url = http://repositorium.sdum.uminho.pt/bitstream/1822/31482/1/document_17753_1.pdf | quote = ''Candida'' species and other microorganisms are involved in this complicated fungal infection, but ''Candida albicans'' continues to be the most prevalent. In the past two decades, it has been observed an abnormal overgrowth in the gastrointestinal, urinary and respiratory tracts, not only in immunocompromised patients, but also related to nosocomial infections and even in healthy individuals. There is a widely variety of causal factors that contribute to yeast infection which means that candidiasis is a good example of a multifactorial syndrome. | hdl = 10198/10147 | s2cid = 795450 | hdl-access = free }}</ref><ref name=Wang2014rev>{{cite journal | vauthors = Wang ZK, Yang YS, Stefka AT, Sun G, Peng LH | title = Review article: fungal microbiota and digestive diseases | journal = Alimentary Pharmacology & Therapeutics | volume = 39 | issue = 8 | pages = 751–66 | date = april 2014 | pmid = 24612332 | doi = 10.1111/apt.12665 | s2cid = 22101484 | quote = In addition, GI fungal infection is reported even among those patients with normal immune status. Digestive system-related fungal infections may be induced by both commensal opportunistic fungi and exogenous pathogenic fungi.&nbsp;... ''Candida'' sp. is also the most frequently identified species among patients with gastric IFI.&nbsp;... It was once believed that gastric acid could kill microbes entering the stomach and that the unique ecological environment of the stomach was not suitable for microbial colonisation or infection. However, several studies using culture-independent methods confirmed that large numbers of acid-resistant bacteria belonging to eight phyla and up to 120 species exist in the stomach, such as ''Streptococcus'' sp., ''Neisseria'' sp. and ''Lactobacillus'' sp. etc.<sup>26, 27</sup> Furthermore, ''Candida albicans'' can grow well in highly acidic environments,<sup>28</sup> and some genotypes may increase the severity of gastric mucosal lesions.<sup>29</sup> | doi-access = free }}</ref><ref name="SIFO">{{cite journal | vauthors = Erdogan A, Rao SS | title = Small intestinal fungal overgrowth | journal = Current Gastroenterology Reports | volume = 17 | issue = 4 | pages = 16 | date = april 2015 | pmid = 25786900 | doi = 10.1007/s11894-015-0436-2 | s2cid = 3098136 | quote = Small intestinal fungal overgrowth (SIFO) is characterized by the presence of excessive number of fungal organisms in the small intestine associated with gastrointestinal (GI) symptoms. Candidiasis is known to cause GI symptoms particularly in immunocompromised patients or those receiving steroids or antibiotics. However, only recently, there is emerging literature that an overgrowth of fungus in the small intestine of non-immunocompromised subjects may cause unexplained GI symptoms. Two recent studies showed that 26 % (24/94) and 25.3 % (38/150) of a series of patients with unexplained GI symptoms had SIFO. The most common symptoms observed in these patients were belching, bloating, indigestion, nausea, diarrhea, and gas.&nbsp;... Fungal-bacterial interaction may act in different ways and may either be synergistic or antagonistic or symbiotic [29]. Some bacteria such as ''Lactobacillus'' species can interact and inhibit both the virulence and growth of ''Candida'' species in the gut by producing hydrogen peroxide [30]. Any damage to the mucosal barrier or disruption of GI microbiota with chemotherapy or antibiotic use, inflammatory processes, activation of immune molecules and disruption of epithelial repair may all cause fungal overgrowth [27]. }}</ref> Najbolje proučene od njih su vrste ''[[Candida (rod)|Candida]]'' zbog svoje sposobnosti da postanu [[patogen]]e kod [[imunodeficijencija|imunokompromitovanih]], pa čak i kod zdravih domaćina.<ref name=Martins2014Candidiasis/><ref name=Wang2014rev/><ref name="SIFO"/> Kvasci su također prisutni na koži,<ref name="mycobiome" /> kao što su vrste roda ''[[Malassezia]]'', gdje konzumiraju ulja izlučena iz [[lojna žlijezda|lojnih žlijezda]].<ref>{{cite journal | vauthors = Marcon MJ, Powell DA | title = Human infections due to Malassezia spp | journal = Clinical Microbiology Reviews | volume = 5 | issue = 2 | pages = 101–19 | date = april 1992 | pmid = 1576583 | pmc = 358230 | doi = 10.1128/CMR.5.2.101 }}</ref><ref>{{cite journal | vauthors = Roth RR, James WD | title = Microbial ecology of the skin | journal = Annual Review of Microbiology | volume = 42 | issue = 1 | pages = 441–64 | year = 1988 | pmid = 3144238 | doi = 10.1146/annurev.mi.42.100188.002301 }}</ref>
 
=== Virusi ===
{{također pogledajte|Ljudski virom}}
[[Virusi]], posebno bakterijski virusi ([[bakteriofag]]i), koloniziraju različita tijelesna područja. Ova kolonizirana mjesta uključuju [[koža|kožu]],<ref>{{cite journal | vauthors = Hannigan GD, Meisel JS, Tyldsley AS, Zheng Q, Hodkinson BP, SanMiguel AJ, Minot S, Bushman FD, Grice EA | display-authors = 6 | title = The human skin double-stranded DNA virome: topographical and temporal diversity, genetic enrichment, and dynamic associations with the host microbiome | journal = mBio | volume = 6 | issue = 5 | pages = e01578-15 | date = oktobar 2015 | pmid = 26489866 | pmc = 4620475 | doi = 10.1128/mBio.01578-15 }}</ref> [[crijeva]],<ref>{{cite journal | vauthors = Minot S, Sinha R, Chen J, Li H, Keilbaugh SA, Wu GD, Lewis JD, Bushman FD | display-authors = 6 | title = The human gut virome: inter-individual variation and dynamic response to diet | journal = Genome Research | volume = 21 | issue = 10 | pages = 1616–25 | date = oktobar 2011 | pmid = 21880779 | pmc = 3202279 | doi = 10.1101/gr.122705.111 }}</ref> [[pluća]],<ref>{{cite journal | vauthors = Young JC, Chehoud C, Bittinger K, Bailey A, Diamond JM, Cantu E, Haas AR, Abbas A, Frye L, Christie JD, Bushman FD, Collman RG | display-authors = 6 | title = Viral metagenomics reveal blooms of anelloviruses in the respiratory tract of lung transplant recipients | journal = American Journal of Transplantation | volume = 15 | issue = 1 | pages = 200–9 | date = januar 2015 | pmid = 25403800 | pmc = 4276431 | doi = 10.1111/ajt.13031 }}</ref> i [[usna šupljina|usnu šupljinu]].<ref>{{cite journal | vauthors = Abeles SR, Robles-Sikisaka R, Ly M, Lum AG, Salzman J, Boehm TK, Pride DT | title = Human oral viruses are personal, persistent and gender-consistent | journal = The ISME Journal | volume = 8 | issue = 9 | pages = 1753–67 | date = septembar 2014 | pmid = 24646696 | pmc = 4139723 | doi = 10.1038/ismej.2014.31 }}</ref> Zajednice virusa su povezane s nekim bolestima i ne odražavaju samo bakterijske zajednice.<ref>{{cite journal | vauthors = Ly M, Abeles SR, Boehm TK, Robles-Sikisaka R, Naidu M, Santiago-Rodriguez T, Pride DT | title = Altered oral viral ecology in association with periodontal disease | journal = mBio | volume = 5 | issue = 3 | pages = e01133-14 | date = maj 2014 | pmid = 24846382 | pmc = 4030452 | doi = 10.1128/mBio.01133-14 }}</ref><ref>{{cite journal | vauthors = Monaco CL, Gootenberg DB, Zhao G, Handley SA, Ghebremichael MS, Lim ES, Lankowski A, Baldridge MT, Wilen CB, Flagg M, Norman JM, Keller BC, Luévano JM, Wang D, Boum Y, Martin JN, Hunt PW, Bangsberg DR, Siedner MJ, Kwon DS, Virgin HW | display-authors = 6 | title = Altered Virome and Bacterial Microbiome in Human Immunodeficiency Virus-Associated Acquired Immunodeficiency Syndrome | journal = Cell Host & Microbe | volume = 19 | issue = 3 | pages = 311–22 | date = mart 2016 | pmid = 26962942 | pmc = 4821831 | doi = 10.1016/j.chom.2016.02.011 }}</ref><ref>{{cite journal | vauthors = Norman JM, Handley SA, Baldridge MT, Droit L, Liu CY, Keller BC, Kambal A, Monaco CL, Zhao G, Fleshner P, Stappenbeck TS, McGovern DP, Keshavarzian A, Mutlu EA, Sauk J, Gevers D, Xavier RJ, Wang D, Parkes M, Virgin HW | display-authors = 6 | title = Disease-specific alterations in the enteric virome in inflammatory bowel disease | journal = Cell | volume = 160 | issue = 3 | pages = 447–60 | date = januar 2015 | pmid = 25619688 | pmc = 4312520 | doi = 10.1016/j.cell.2015.01.002 }}</ref>

== Također pogledajte==
{{div col|colwidth=27em}}
* [[Molekule koje oslobađaju ugljični monoksid]]
* [[Otpornost na lijekove]]
* [[Projekt ljudskog mikrobioma]]
* [[Mikrobiom ljudskog mlijeka]]
* [[Ljudski virom]]
* [[Početno sticanje mikrobiote]]
* [[Lista mikrobiote bakterijske vaginoze]]
* [[Mikrobiom]]
* [[Mreža Svjetske zajednice|Projekt imunosti mikrobioma]]
* [[Mikroorganizam]]
* [[Mikrobiom]]
{{div col end}}
 
 
== Reference ==
{{Reflist|30em}}
 
==Dopunska literarura==
* Ed Yong. ''I Contain Multitudes: The Microbes Within Us and a Grander View of Life.'' 368 pages, Published 9 August 2016 by Ecco, {{ISBN|0062368591}}.
 
== Vanjski linkovi ==
* [http://www.amnh.org/calendar/the-secret-world-inside-you The Secret World Inside You] Exhibit 2015–2016, American Museum of Natural History
* [https://web.archive.org/web/20161231092333/http://academy.asm.org/index.php/faq-series/5122-humanmicrobiome FAQ: Human Microbiome, January 2014] American Society For Microbiology
 
{{Mikrobiota | state = collapsed}}
{{bakterije}}
{{Personalna genomika}}
{{Portal|Biologija|Medicina}}

{{DEFAULTSORT:Human Flora}}
[[Kategorija:Bakteriologija]]
[[Kategorija:Bakterije i ljudi]]
[[Kategorija:Mikrobiologija]]
[[Kategorija:Mikrobiomi]]
[[Kategorija:Mikrobiologija životne sredine]]
[[Kategorija:Crijeva flora| ]]
[[Kategorija:Projekti ljudskog genoma]]

Šabloni koji su upotrebljeni na ovoj stranici:

Šablon:Bakterije (uredi)
Šablon:Cite book (pogledaj izvor) (poluzaštićeno)
Šablon:Cite journal (uredi)
Šablon:Cite web (uredi)
Šablon:Distinguish (uredi)
Šablon:Div col (uredi)
Šablon:Div col/styles.css (uredi)
Šablon:Div col end (uredi)
Šablon:En dash (uredi)
Šablon:Google books (uredi)
Šablon:ISBN (uredi)
Šablon:Main other (uredi)
Šablon:Mikrobiota (uredi)
Šablon:Namespace detect (uredi)
Šablon:Navbox (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Šablon:Navkutija (pogledaj izvor) (poluzaštićeno)
Šablon:Ndash (uredi)
Šablon:Niz dotjeraj (uredi)
Šablon:Personalna genomika (uredi)
Šablon:Portal (uredi)
Šablon:Razlikovati (uredi)
Šablon:Reflist (uredi)
Šablon:Refspisak (uredi)
Šablon:Refspisak/styles.css (uredi)
Šablon:Rp (uredi)
Šablon:Također pogledajte (uredi)
Šablon:Trim (uredi)
Šablon:Vremenska linija života (uredi)
Šablon:Webarchive (uredi)
Modul:Arguments (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Check isxn (uredi)
Modul:Citation/CS1 (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Citation/CS1/COinS (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Citation/CS1/Configuration (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Citation/CS1/Date validation (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Citation/CS1/Identifiers (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Citation/CS1/Utilities (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Citation/CS1/Whitelist (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Citation/CS1/styles.css (uredi)
Modul:Distinguish (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Hatnote (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Hatnote list (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Namespace detect (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Namespace detect/config (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Namespace detect/data (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Navbar (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Navbar/configuration (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Navbar/styles.css (uredi)
Modul:Navbox (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:No globals (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Portal (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Portal/images/b (uredi)
Modul:Portal/images/m (uredi)
Modul:See also (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:TableTools (pogledaj izvor) (poluzaštićeno)
Modul:Webarchive (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Webarchive/data (pogledaj izvor) (poluzaštićeno)
Modul:Yesno (pogledaj izvor) (zaštićeno)

Nazad na Ljudski mikrobiom.

Preuzeto iz "https://bs.wikipedia.org/wiki/Ljudski_mikrobiom"