Izvorni kôd stranice IRF6

Nemate dopuštenje da uredite ovu stranicu, iz sljedećeg razloga:

Your IP address is in a range that has been blocked on all Wikimedia Foundation wikis.

The block was made by ‪EPIC‬. The reason given is Open proxy/Webhost: See the help page if you are affected.

Start of block: 09:48, 2 juli 2024
Expiry of block: 09:48, 2 juli 2025

Your current IP address is 206.189.44.186. The blocked range is 206.189.32.0/20.

Navedite sve gornje podatke u upite ili zahtjeve za deblokadu. Ako smatrate da ste greškom blokirani, dodatne informacije i uputstva možete pronaći na stranici o globalnoj smjernici "Zabranjeni otvoreni proksiji".

U suprotnom, zahtjev za blokadu postavite na Meta-Wikiju. You could also send an email to the stewards VRT queue at stewards@wikimedia.org including all above details.

Možete vidjeti i kopirati izvorni kôd ove stranice.

{{Infokutija gen}}
'''[[Interferon]]ski regulatorni faktor 6''', znan i kao '''IRF6''', jest [[protein]] koji je kod [[ljudi]] [[kodon|kodiran]] [[gen]]om '''IRF6''' sa  [[hromosom 1|hromosoma 1]]..<ref name="pmid12219090">{{cite journal |vauthors=Kondo S, Schutte BC, Richardson RJ, Bjork BC, Knight AS, Watanabe Y, Howard E, de Lima RL, Daack-Hirsch S, Sander A, McDonald-McGinn DM, Zackai EH, Lammer EJ, Aylsworth AS, Ardinger HH, Lidral AC, Pober BR, Moreno L, Arcos-Burgos M, Valencia C, Houdayer C, Bahuau M, Moretti-Ferreira D, Richieri-Costa A, Dixon MJ, Murray JC | title = Mutations in IRF6 cause Van der Woude and popliteal pterygium syndromes | journal = Nat. Genet. | volume = 32 | issue = 2 | pages = 285–9 |date=oktobar 2002 | pmid = 12219090 | doi = 10.1038/ng985 | pmc = 3169431 }}</ref>
                             
==Aminokiselinska sekvenca==	
Dužina [[polipeptid]]nog lanca je 467 [[aminokiselina]], a [[molekularna masa|molekulska težina]] 53.130 [[dalton (jedinica)|Da]].<ref name="UniProt">{{cite web|url=http://www.uniprot.org/uniprot/O14896#sequences |title=UniProt, O14896 |language=en |access-date=13. 12. 2021}}</ref>
{{legenda aminokiselina}}
<table  style="font-family:monospace;">
<tr style="text-align:right;"><th>10</th><th></th><th>20</th><th></th><th>30</th><th></th><th>40</th><th></th><th>50</th></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>MALHPRRVRL</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>KPWLVAQVDS</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>GLYPGLIWLH</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>RDSKRFQIPW</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>KHATRHSPQQ</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>EEENTIFKAW</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>AVETGKYQEG</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>VDDPDPAKWK</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>AQLRCALNKS</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>REFNLMYDGT</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>KEVPMNPVKI</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>YQVCDIPQPQ</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>GSIINPGSTG</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>SAPWDEKDND</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>VDEEDEEDEL</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>DQSQHHVPIQ</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>DTFPFLNING</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>SPMAPASVGN</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>CSVGNCSPEA</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>VWPKTEPLEM</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>EVPQAPIQPF</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>YSSPELWISS</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>LPMTDLDIKF</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>QYRGKEYGQT</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>MTVSNPQGCR</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>LFYGDLGPMP</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>DQEELFGPVS</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>LEQVKFPGPE</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>HITNEKQKLF</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>TSKLLDVMDR</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>GLILEVSGHA</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>IYAIRLCQCK</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>VYWSGPCAPS</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>LVAPNLIERQ</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>KKVKLFCLET</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>FLSDLIAHQK</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>GQIEKQPPFE</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>IYLCFGEEWP</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>DGKPLERKLI</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>LVQVIPVVAR</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>MIYEMFSGDF</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>TRSFDSGSVR</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>LQISTPDIKD</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>NIVAQLKQLY</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>RILQTQESWQ</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>PMQPTPSMQL</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>PPALPPQ</td></tr>
</table>

== Funkcija ==
Ovaj gen kodira člana porodice [[regulatorni faktori interferona|interferonskih regulatornih transkripcijskih faktora]] (IRF). Članovi porodice dijele visoko konzerviran [[N-terminus|N-terminal]] [[helix-turn-helix]] DNK-vezujući domen i manje očuvan [[C-terminus|C-terminal]] domen za vezivanje proteina.<ref name="entrez">{{cite web | title = Entrez Gene: IRF6 | url = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=3664 }}</ref> Funkcija IRF6 povezana je s formiranjem [[vezivno tkivo|veznog tkiva]], na primjer onog [[mehko nepce|nepca]].<ref name="pmid16096995">{{cite journal |vauthors=Blanton SH, Cortez A, Stal S, Mulliken JB, Finnell RH, Hecht JT | title = Variation in IRF6 contributes to nonsyndromic cleft lip and palate | journal = Am. J. Med. Genet. A | volume = 137A | issue = 3 | pages = 259–62 |date=septembar 2005 | pmid = 16096995 | doi = 10.1002/ajmg.a.30887| s2cid = 25084563 | doi-access = free }}</ref>  Ovaj gen kodira člana porodice [[interferon]]skog regulatornog [[transkripcijski faktor|transkripcionog faktora]] (IRF). Osim toga, uočeno je da je gen IRF6 pod [[epigenetika|epigenetičkom]] regulacijom promotora [[metilacija DNK|metilacij DNK]].<ref name="pmid27223861">{{cite journal |vauthors=Rotondo JC, Borghi A, Selvatici R, Magri E, Bianchini E, Montinari E, Corazza M, Virgili A, Tognon M, Martini F | title = Hypermethylation-Induced Inactivation of the IRF6 Gene as a Possible Early Event in Progression of Vulvar Squamous Cell Carcinoma Associated With Lichen Sclerosus | journal = JAMA Dermatology | volume = 152| issue = 8 | pages = 928–33 |date=2016 | pmid = 27223861 | doi = 10.1001/jamadermatol.2016.1336 }}</ref>

== Patologija ==
[[Mutacija]] IRF6 [[gen]]a može dovesti do [[autosomno nasljeđivanje|autosomno dominantnog]] [[van der Woudeov sindrom|van der Woudeovog sindroma]] (VWS)<ref name="pmid13158329">{{cite journal | author = Van der Woude, A | title = Fistula labii inferioris congenita and its association with cleft lip and palate | journal = Am. J. Hum. Genet. | volume = 6 | issue = 2 | pages = 244–56 |date=juni 1954 | pmid = 13158329 | pmc = 1716548 }}</ref> ili srodnog [[sindrom poplitelnog pterigija|sindroma poplitelnog pterigija]] (PPS).<ref name="pmid4384166">{{cite journal |vauthors=Gorlin RJ, Sedano HO, Cervenka J | title = Popliteal pterygium syndrome . A syndrome comprising cleft lip-palate, popliteal and intercrural pterygia, digital and genital anomalies |url=https://archive.org/details/sim_pediatrics_1968-02_41_2/page/503 | journal = Pediatrics | volume = 41 | issue = 2 | pages = 503–9 |date=februar 1968 | pmid = 4384166 }}</ref>  Van der Woudeov sindrom može uključivati  [[rascjep usne i nepca]], zajedno sa dentalnim anomalijama i fistulama [[usna|usana]]. Osim toga, uobičajeni [[alel]]i u IRF6 su također povezani sa nesindromskim slučajevima rascjepa usne i/ili nepca prema  [[GWAS|studiji asocijacije na cijelom genomu]] i u mnogim studijama kandidata za gen.<ref name="pmid21331089">{{cite journal |vauthors=Dixon MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC | title = Cleft lip and palate: understanding genetic and environmental influences | journal = Nat. Rev. Genet. | volume = 12 | issue = 3 | pages = 167–78 |date=mart 2011 | pmid = 21331089 | pmc = 3086810 | doi = 10.1038/nrg2933 }}</ref> Ovi poremećaji uzrokovani su mutacijama u genu IRF6, a dio [[fenotip]]ske heterogenosti uzrokovan je različitim tipovima [[mutacija]] IRF6-a.<ref name="pmid12219090"/>
Jedno objašnjenje za ovu fenotipsku varijaciju između sindroma zasniva se na različitom uticaju na strukturu [[proteinski dimer|dimerizovanih]] mutantnih proteina. Čini se da VWS mutacije rezultiraju [[haploinsuficijencija|haploinsuficijencijom]] dok PPS mutacije mogu biti [[dominantni gen|dominantno negativne]] prirode.<ref name="pmid19036739">{{cite journal |vauthors=Little HJ, Rorick NK, Su LI, Baldock C, Malhotra S, Jowitt T, Gakhar L, Subramanian R, Schutte BC, Dixon MJ, Shore P | title = Missense mutations that cause Van der Woude syndrome and popliteal pterygium syndrome affect the DNA-binding and transcriptional activation functions of IRF6 | journal = Hum. Mol. Genet. | volume = 18| issue = 3| pages = 535–45|date=novembar 2008 | pmid = 19036739 | doi = 10.1093/hmg/ddn381 | pmc = 2638798 }}</ref> Spektar mutacija u VWS i PPS nedavno je sumarizovan.<ref name="pmid19282774">{{cite journal  |vauthors=de Lima RL, Hoper SA, Ghassibe M, etal | title = Prevalence and non-random distribution of exonic mutations in Interferon Regulatory Factor 6 (IRF6) in 307 families with Van der Woude syndrome and 37 families with popliteal pterygium syndrome | journal = Genet. Med. | volume = 11 | issue = 4 | pages = 241–7 |date=april 2009 | pmid = 19282774 | pmc = 2789395 | doi = 10.1097/GIM.0b013e318197a49a }}</ref> Pokazalo se da IRF6 ima ključnu ulogu u razvoju [[keratinocit]]a.<ref name="pmid17041603">{{cite journal |vauthors=Richardson RJ, Dixon J, Malhotra S, Hardman MJ, Knowles L, Boot-Handford RP, Shore P, Whitmarsh A, Dixon MJ | title = Irf6 is a key determinant of the keratinocyte proliferation-differentiation switch | journal = Nat. Genet. | volume = 38 | issue = 11 | pages = 1329–34 |date=novembar 2006 | pmid = 17041603 | doi = 10.1038/ng1894 | s2cid = 13102953 }}</ref><ref name="pmid17041601">{{cite journal |vauthors=Ingraham CR, Kinoshita A, Kondo S, Yang B, Sajan S, Trout KJ, Malik MI, Dunnwald M, Goudy SL, Lovett M, Murray JC, Schutte BC | title = Abnormal skin, limb and craniofacial morphogenesis in mice deficient for interferon regulatory factor 6 (Irf6) | journal = Nat. Genet. | volume = 38 | issue = 11 | pages = 1335–40 |date=novembar 2006 | pmid = 17041601 | pmc = 2082114 | doi = 10.1038/ng1903 }}</ref> Uloga IRF6 u uobičajenim oblicima je također demonstrirana je i u slučajevima  [[rascjep usne i nepca|rascjepa usne i nepca]] <ref name="pmid15317890">{{cite journal |vauthors=Zucchero TM, Cooper ME, Maher BS, Daack-Hirsch S, Nepomuceno B, Ribeiro L, Caprau D, Christensen K, Suzuki Y, Machida J, Natsume N, Yoshiura K, Vieira AR, Orioli IM, Castilla EE, Moreno L, Arcos-Burgos M, Lidral AC, Field LL, Liu YE, Ray A, Goldstein TH, Schultz RE, Shi M, Johnson MK, Kondo S, Schutte BC, Marazita ML, Murray JC | title = Interferon regulatory factor 6 (IRF6) gene variants and the risk of isolated cleft lip or palate | journal = N. Engl. J. Med. | volume = 351 | issue = 8 | pages = 769–80 |date=august 2004 | pmid = 15317890 | doi = 10.1056/NEJMoa032909 }}</ref> i može objasniti samo ~20% slučajeva rascjepa usne.<ref name="pmid18836445">{{cite journal | vauthors = Rahimov F, Marazita ML, Visel A, Cooper ME, Hitchler MJ, Rubini M, Domann FE, Govil M, Christensen K, Bille C, Melbye M, Jugessur A, Lie RT, Wilcox AJ, Fitzpatrick DR, Green ED, Mossey PA, Little J, Steegers-Theunissen RP, Pennacchio LA, Schutte BC, Murray JC | title = Disruption of an AP-2α binding site in an IRF6 enhancer is strongly associated with cleft lip | journal = Nat. Genet. | volume = 40 | issue = 11 | pages = 1341–7 |date=novembar 2008 | pmid = 18836445 | doi = 10.1038/ng.242 | pmc = 2691688 }}</ref> Varijante u IRF6 dale su dosljedne dokaze o povezanosti sa sindromskim rascjepom i/ili nepcem u više studija. Studija Birnbauma i kolega iz 2009. godine potvrdila je uticaj ovog gena na etiologiju rascjepa usne i/ili nepca, a studija GENEVA Cleft Consortium, koja je proučavala porodice iz više [[populacija]], ponovo je potvrdila nalaze da su mutacije IRF6 snažno povezane s rascjepom usne i/ili nepca. Uloga IRF6 u izazivanju rascjepa usne i/ili nepca dalje je podržana analizom IRF6 mutantnih miševa koji pokazuju hiperproliferativnu [[epiderma|epidermu]] koja ne prolazi kroz terminalnu [[ćelijska diferencijacija|diferencijaciju]], što dovodi do višestrukih [[epitel]]nih [[ćelijska adhezija|adhezija]] koje mogu začepiti usnu šupljinu i rezultirati rascjepom nepca. Istraživanja na životinjskim modelima pokazuju da IRF6 određuje [[ćelijska proliferacija|proliferaciju]] [[keratinocit]]a i također ima ključnu ulogu u formiranju usnn [[epiderma|periderme]]. Nedavno, korištenjem genetike miša, analiza [[ekspresije gena]], studija imunoprecipitacije [[hromatin]]a i testova reportera luciferaze, pokazalo se da je IRF6 direktna meta p63, koji je u osnovi nekoliko sindromskih malformacija, koje uključuju obilježja rascjepa, a p63 aktivira transkripciju IRF6 putem IRF6 pojačivačkog elementa. Varijacije u elementu pojačivača povećavaju podložnost samo rascjepu usne. I [[rascjep usne]] sa ili bez [[rascjep nepca|rascjepa nepca]] i samo rascjepom nepca uočene su u porodicama sa mutacijom IRF6-a. Osim toga, različiti tipovi rascjepa mogu se odvojiti unutar iste porodice.<ref name="pmid21331089"/>

== [[Epigenetika]] ==

Uočeno je  da je aberantni promotor IRF6 [[metilacija|hipermetilacije DNK]] povezan sa pojavom/progresijom raka. Zaista, ovaj neprikladan [[Epigenetika|epigenetički]] fenomen uočen je kod žena zahvaćenih [[rak vulve|kancerom vulvinih pločastih ćelija]] nastao je iz ''[[Lichen sclerosus|vulver lichen sclerosus]]''.<ref name = "Rotondo_201">{{cite journal | vauthors = Rotondo JC, Borghi A, Selvatici R, Magri E, Bianchini E, Montinari E, Corazza M, Virgili A, Tognon M, Martini F | title = Hypermethylation-Induced Inactivation of the IRF6 Gene as a Possible Early Event in Progression of Vulvar Squamous Cell Carcinoma Associated With Lichen Sclerosus. | journal = JAMA Dermatology | volume = 152| issue = 8| pages = 928–33 | date = 2016 | pmid = 27223861 | doi = 10.1001/jamadermatol.2016.1336 }}</ref> [[Metilacija]] promotora IRF6 može biti marker rizika od raka kod pacijenata oboljelih od ove bolesti.<ref name="pmid27223861"/>

== Kancer ==
Uočeno je da je gen IRF6 progresivno smanjen u [[ljudski papiloma virus]]-pozitivnim [[Neoplazma|neoplastični keratinociti]] izvedenim iz cerviksne [[Cerviksna unutalepitelna neoplazija|preneoplazijske lezije]] na različitim nivoima malignosti.<ref name = "Rotondo_2015">{{cite journal | vauthors = Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F | title = Gene expression changes in progression of cervical neoplasia revealed by microarray analysis of cervical neoplastic keratinocytes. | journal = J Cell Physiol | volume = 230| issue = 4 | pages = 802–812 | date = april 2015 | pmid = 25205602 | doi = 10.1002/jcp.24808| s2cid = 24986454 }}</ref> Iz tog razloga, ovaj gen je vjerovatno povezan s [[tumorigeneza|tumorigenezom]] i može biti potencijalni prognostički marker za progresiju [[neoplazija|preneoplazijske lezije]] [[grlić maternice|grlića maternice]].<ref name="Rotondo_2015"/> Slično tome, otkriveno je da je IRF6 genetički i epigenetički nereguliran u [[rak vulve|raku vulve]].<ref name="pmid27223861"/>

== Također pogledajte ==
* [[Interferonski regulatorni faktori]]

== Reference ==
{{Reflist|2}}

== Vanjski linkovi ==
* [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=gene&part=vws  GeneReview/NIH/UW entry on IRF6-Related Disorders]
* {{MeshName|IRF6+protein,+human}}
* {{UCSC genome browser|IRF6}}
* {{UCSC gene details|IRF6}}

{{JAK-STAT signalni put}}
{{Transkripcijski faktori|g3}}
{{NLM content}}

[[Kategorija:Geni na hromosomu 1]]
[[Kategorija:Transkripcijski faktori]]
[[Kategorija:Ljudski proteini]]
[[Kategorija:Proteomika]]

Šabloni koji su upotrebljeni na ovoj stranici:

Šablon:Bezpodebljanja (uredi)
Šablon:Bezpodebljanja/styles.css (uredi)
Šablon:Cite journal (uredi)
Šablon:Cite web (uredi)
Šablon:Div col (uredi)
Šablon:Div col/styles.css (uredi)
Šablon:Div col end (uredi)
Šablon:Infokutija gen (uredi)
Šablon:JAK-STAT signalni put (uredi)
Šablon:Legenda aminokiselina (uredi)
Šablon:MeSH name (uredi)
Šablon:MeshName (uredi)
Šablon:NLM content (uredi)
Šablon:Navbox (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Šablon:Navbox with collapsible groups (uredi)
Šablon:Navkutija (pogledaj izvor) (poluzaštićeno)
Šablon:Nobold (uredi)
Šablon:Reflist (uredi)
Šablon:Refspisak (uredi)
Šablon:Refspisak/styles.css (uredi)
Šablon:Transkripcijski faktori (uredi)
Šablon:UCSC gen detalji (uredi)
Šablon:UCSC gene details (uredi)
Šablon:UCSC genome browser (uredi)
Modul:Arguments (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Citation/CS1 (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Citation/CS1/COinS (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Citation/CS1/Configuration (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Citation/CS1/Date validation (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Citation/CS1/Identifiers (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Citation/CS1/Utilities (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Citation/CS1/Whitelist (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Citation/CS1/styles.css (uredi)
Modul:Infobox3cols (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:InfoboxImage (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Infokutija gen (uredi)
Modul:Navbar (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Navbar/configuration (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:Navbar/styles.css (uredi)
Modul:Navbox (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:No globals (pogledaj izvor) (zaštićeno)
Modul:String (pogledaj izvor) (zaštićeno)

Nazad na IRF6.

Preuzeto iz "https://bs.wikipedia.org/wiki/IRF6"