X-izoforma 40S ribosomskog proteina S4 je protein koji je kod ljudi kodiran genom RPS4X.[5][6][7]

RPS4X
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

4UG0, 4V6X, 5A2Q, 3J7R, 3J7P

Identifikatori
AliasiRPS4X
Vanjski ID-jeviOMIM: 312760 MGI: 98158 HomoloGene: 90857 GeneCards: RPS4X
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom X
Hrom.Hromosom X[1]
Hromosom X
Genomska lokacija za RPS4X
Genomska lokacija za RPS4X
BendXq13.1Početak72,255,679 bp[1]
Kraj72,277,248 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom X (miš)
Hrom.Hromosom X (miš)[2]
Hromosom X (miš)
Genomska lokacija za RPS4X
Genomska lokacija za RPS4X
BendX D|X 45.2 cMPočetak101,228,547 bp[2]
Kraj101,233,000 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija rRNA binding
structural constituent of ribosome
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje sa RNK
Ćelijska komponenta citoplazma
polysome
citosol
ribozom
membrana
focal adhesion
intracellular anatomical structure
cytosolic small ribosomal subunit
small ribosomal subunit
cytoplasmic ribonucleoprotein granule
Egzosom
GO:0005578 Vanćelijski matriks
nukleoplazma
ribonukleoprotein
sinapsa
Biološki proces viral transcription
positive regulation of translation
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
multicellular organism development
positive regulation of cell population proliferation
translational initiation
Nonsens-posredovano propadanje iRNK
rRNA processing
Biosinteza bjelančevina
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001007

NM_009094

RefSeq (bjelančevina)

NP_000998

NP_033120

Lokacija (UCSC)Chr X: 72.26 – 72.28 MbChr X: 101.23 – 101.23 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Ribosomi, organele koje [kataliziraju sintezu proteina sastoje se od male 40S podjedinice i velike 60S podjedinice. Zajedno, ove podjedinice sastoje se od četiri tipa molekula RNK i približno 80 strukturno različitih proteina. Ovaj gen kodira ribosomski protein S4, komponentu 40S podjedinice. Ribosomski protein S4 jedini je ribosomski protein za koji je poznato da ga kodira više od jednog gena: ovaj gen i onaj za ribosomski protein S4, Y-vezani (RPS4Y). Dvije izoforme koje kodiraju ovi geni nisu identične, ali su funkcijski ekvivalenti. Ribosomski protein S4 pripada porodici ribosomskih proteina S4E. Ovaj gen nije podložan X-inaktivaciji. Sugerira se da haploinsuficijencija gena ribosomskog proteina S4 ima ulogu u pojavi Turnerovog sindroma; međutim, ova hipoteza pokazala se kao kontroverzna. Kao što je uobičajreno za gene koji kodiraju ribosomske proteine, postoji više obrađenih pseudogena ovog gena raspršenih širom genoma.[7]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000198034 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031320 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Watanabe M, Furuno N, Goebl M, Go M, Miyauchi K, Sekiguchi T, Basilico C, Nishimito T (Apr 1992). "Molecular cloning of the human gene, CCG2, that complements the BHK-derived temperature-sensitive cell cycle mutant tsBN63: identity of CCG2 with the human X chromosomal SCAR/RPS4X gene". J Cell Sci. 100 (1): 35–43. PMID 1795030.
  6. ^ Zinn AR, Alagappan RK, Brown LG, Wool I, Page DC (Apr 1994). "Structure and function of ribosomal protein S4 genes on the human and mouse sex chromosomes". Mol Cell Biol. 14 (4): 2485–92. doi:10.1128/mcb.14.4.2485. PMC 358616. PMID 8139551.
  7. ^ a b "Entrez Gene: RPS4X ribosomal protein S4, X-linked".

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi