Kalpain-10 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom CAPN10 sa p kraka hromosoma 2.[5][6]

Kalpain-10
Identifikatori
AliasiCAPN10
Vanjski ID-jeviOMIM: 605286 MGI: 1344392 HomoloGene: 36323 GeneCards: CAPN10
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 2 (čovjek)
Hrom.Hromosom 2 (čovjek)[1]
Hromosom 2 (čovjek)
Genomska lokacija za Kalpain-10
Genomska lokacija za Kalpain-10
Bend2q37.3Početak240,586,734 bp[1]
Kraj240,617,705 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 1 (miš)
Hrom.Hromosom 1 (miš)[2]
Hromosom 1 (miš)
Genomska lokacija za Kalpain-10
Genomska lokacija za Kalpain-10
Bend1|1 DPočetak92,862,098 bp[2]
Kraj92,875,663 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija cytoskeletal protein binding
GO:0070122 peptidase activity
cysteine-type peptidase activity
hydrolase activity
SNARE binding
calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity
Ćelijska komponenta intracellular anatomical structure
citosol
ćelijska membrana
mitohondrija
citoplazma
Biološki proces actin cytoskeleton reorganization
positive regulation of glucose import
cellular component disassembly involved in execution phase of apoptosis
positive regulation of intracellular transport
positive regulation of type B pancreatic cell apoptotic process
Proteoliza
positive regulation of insulin secretion
cellular response to insulin stimulus
type B pancreatic cell apoptotic process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_023089
NM_021251
NM_023083
NM_023084
NM_023085

NM_023086
NM_023087
NM_023088

NM_011796

RefSeq (bjelančevina)

NP_075571
NP_075573

NP_035926

Lokacija (UCSC)Chr 2: 240.59 – 240.62 MbChr 1: 92.86 – 92.88 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 672 aminokiseline, a molekulska težina 74.952 Da.[7]

1020304050
MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSLFCDLSTPLAQFREDITWRRPQEIC
ATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSW
ADQEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPL
LEKVYAKVHGSYEHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRP
GRWEHRTCRQLLHLKDQCLISCCVLSPRAGARELGEFHAFIVSDLRELQG
QAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWREGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGE
FWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERLLCHTRALPGAWVKGQ
SAGGCRNNSGFPSNPKFWLRVSEPSEVYIAVLQRSRLHAADWAGRARALV
GDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPPVAGTACHA
YDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVA
KNTTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPE
GPGPRCVRITLHQHCRPSDTEFHPIGFHIFQVPEGGRSQDAPPLLLQEPL
LSCVPHRYAQEVSRLCLLPAGTYKVVPSTYLPDTEGAFTVTIATRIDRPS
IHSQEMLGQFLQEVSIMAVMKT

Funkcija

uredi

Kalpaini su sveprisutna, dobro konzervirana porodica cisteinskih proteaza zavisnih od kalcija. Tipski kalpainski proteini su heterodimeri koji se sastoje od nepromjenjive male podjedinice i varijabilnih velikih podjedinica. Velika katalitska podjedinica ima četiri domena: domen I, N-terminalni regulatorni domen koji se obrađuje nakon aktivacije kalpaina; domen II, domen proteaze; domen III, domen linkera nepoznate funkcije; i domen IV, domen sličan kalmodulinu koji vezuje kalcij. Interfejs heterodimera se pretežno nalazi između domena IV i male podjedinice, koja je također domen sličan kalmodulinu koji vezuje kalcij. Ovaj gen kodira veliki podjedinicu. |To je atipičan kalpain po tome što mu nedostaje domena koja veže kalcijum nalik kalmodulinu i umjesto toga ima divergentni C-terminalni domen. Stoga se ne može heterodimerizirati s malom podjedinicom. Po organizaciji je sličan kalpainima 5 i 6. Ovaj gen je povezan sa tipom 2 ili insulin-zavisnim dijabetes melitusom (NIDDM) i nalazi se unutar NIDDM1 regiona. Za ovaj gen opisane su višestruke alternativne varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme.[7]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000142330 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026270 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Horikawa Y, Oda N, Cox NJ, Li X, Orho-Melander M, Hara M, Hinokio Y, Lindner TH, Mashima H, Schwarz PE, del Bosque-Plata L, Horikawa Y, Oda Y, Yoshiuchi I, Colilla S, Polonsky KS, Wei S, Concannon P, Iwasaki N, Schulze J, Baier LJ, Bogardus C, Groop L, Boerwinkle E, Hanis CL, Bell GI (Nov 2000). "Genetic variation in the gene encoding calpain-10 is associated with type 2 diabetes mellitus" (PDF). Nat Genet. 26 (2): 163–75. doi:10.1038/79876. PMID 11017071. S2CID 5940859. Arhivirano s originala (PDF), 21. 9. 2017. Pristupljeno 3. 4. 2023.
  6. ^ Baier LJ, Permana PA, Yang X, Pratley RE, Hanson RL, Shen GQ, Mott D, Knowler WC, Cox NJ, Horikawa Y, Oda N, Bell GI, Bogardus C (Oct 2000). "A calpain-10 gene polymorphism is associated with reduced muscle mRNA levels and insulin resistance". J Clin Invest. 106 (7): R69–73. doi:10.1172/JCI10665. PMC 387246. PMID 11018080.
  7. ^ a b "Entrez Gene: CAPN10 calpain 10".

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi